Temas Subtemas
B1T1.- INTRODUCCIÓN


 Introducción y desarrollo de la asignatura.
BLOQUE 2: TÉCNICAS EXPERIMENTALES DE DETERMINACIÓN.
B2T1.- ESTRUCTURA DE PROTEÍNAS Y ÁCIDOS NUCLEICOS POR CRISTALOGRAFÍA DE RAYOS X. 		Conceptos básicos. Cristales y simetría. Difracción de rayos X. El problema de la fase. Métodos de resolución estructural. Trazado de la cadena polipeptídica y refinamiento. El modelo final. Validación del modelo estructural. Modos de representación estructural. Complementariedad de las técnicas estructurales.
B2T2.- ESTRUCTURA DE PROTEÍNAS Y ÁCIDOS NUCLEICOS POR RESONANCIA MAGNÉTICA NUCLEAR. Fundamentos. Parámetros medibles: Desplazamiento químico, acoplamiento escalar. Efecto nuclear Overhauser (NOE). Detección de enlaces de hidrógeno. Acoplamientos dipolares residuales. Determinación de estructuras mediante RMN.
B2T3.- GRANDES ENSAMBLADOS MOLECULARES Y PROTEÍNAS DE MEMBRANA. Complejos macromoleculares. Localización de ejes de simetría local. Utilización de Microscopía electrónica. Cristalización de proteínas de membrana.
B2T4.- PREDICCIÓN DE LA ESTRUCTURA DE LAS PROTEÍNAS. Introducción. Predicción de características unidimensionales: estructura secundaria, hidrofobicidad, accesibilidad, etc. Modelado por homología. Modelado mediante threading o diseño por homología remota. Métodos ab initio. Evaluación de los métodos de predicción.
B2T5.- Trabajo teórico y de interpretación de datos experimentales. Un ejemplo de purificación y caracterización de la estructura de una proteína.
BLOQUE 3: INTERACCIONES ENTRE BIOMOLÉCULAS y con ligandos Determinación de interacciones entre biomoléculas y con ligandos .- El método del doble híbrido. Método de split-ubiquitina. Pull-down. GST-Pull-down. FRET. Ensayos EMSA. Ensayos CHIP. Otras metodologías
Trabajo teórico y de interpretación de datos experimentales sobre un ejemplo de interacción de proteínas con ácidos nucléicos
Trabajo teórico y de interpretación de datos experimentales sobre un ejemplo de interacción de biomoléculas por FRET
Temario prácticas de aula de informática P1: Uso de programas informáticos para el visionado de estructuras.
P2: Predicción de estructura de proteínas.