Datos Identificativos 2012/13
Asignatura (*) Bioinformática Código 610475104
Titulación
Mestrado Universitario en Biotecnoloxía Avanzada
Descriptores Ciclo Período Curso Tipo Créditos
Mestrado Oficial 1º cuadrimestre
 Primeiro Obrigatoria 3
Idioma
Castelán
Galego
Inglés
Prerrequisitos
Departamento Bioloxía Celular e Molecular
Tecnoloxías da Información e as Comunicacións
Coordinación
Dorado de la Calle, Julian
 Correo electrónico
julian.dorado@udc.es
Profesorado
Becerra Fernandez, Manuel
Dorado de la Calle, Julian
Rodriguez Torres, Ana Maria
 Correo electrónico
manuel.becerra@udc.es
julian.dorado@udc.es
ana.rodriguez.torres@udc.es
Web http://webs.uvigo.es/masterbiotecnoloxiaavanzada/
Descrición xeral La realización de experimentos en biología genera cada vez un mayor número de datos. La gestión y análisis de estos datos sería ya imposible sin la utilización de herramientas informáticas dentro de la disciplina de la bioinformática.
En la bioinformática se mezclan conocimientos y técnicas de la informática y las matemáticas aplicadas a las ciencias de la vida, en especial la biología.
Dentro de la bioinformática se estudia la codificación de datos y su almacenamiento en bases de datos. La disponibilidad y el acceso a bases de datos y la aplicación de distintos algoritmos de procesado de datos.
En esta asignatura se verá la aplicación de la bioinformática a distintos ámbitos de la biología molecular desde el análisis de secuencias al estudio de la estructura de proteínas y ácidos nucleicos.

Competencias do título
Código Competencias da titulación
A7 Saber buscar, obter e interpretar a información das bases de datos biolóxicos: xenómicas, proteómicas, transcriptómicas e metabolómicas e utilizar as ferramentas básicas da bioinformática.
B1 Capacidade de análise e síntese (localización de problemas e identificación das causas e a súa tipoloxía).
B3 Capacidade de xestión da información (con apoio de tecnoloxías da información e as comunicacións).
B13 Aprendizaxe autónoma.
C3 Utilizar as ferramentas básicas das tecnoloxías da información e as comunicacións (TIC) necesarias para o exercicio da súa profesión e para a aprendizaxe ao longo da súa vida.
C6 Valorar criticamente o coñecemento, a tecnoloxía e a información dispoñible para resolver os problemas cos que deben enfrontarse.

Resultados de aprendizaxe
Competencias de materia (Resultados de aprendizaxe) Competencias da titulación
Poder utilizar y gestionar de forma básica sistemas operativos basados en Unix AM7
 BM3
BM13
Ser capaz de acceder y buscar en bases de datos de ácidos nucleicos, proteínas y estructuras AM7
 BM3
BM13
Ser capaz de alinear y comparar secuencias de ADN y proteínas. AM7
 BM1
BM3
BM13
Poder construir árboles filogenéticos moleculares AM7
 BM3
BM13
Saber anotar y ensamblar secuencias AM7
 BM3
BM13
Ser capaz de realizar una predicción de las características unidimensionales y de la estructura tridimensional de una proteína basándose en datos y programas disponibles en la web AM7
 BM1
BM3
 CM3
CM6

Contidos
Temas Subtemas
Introducción a la Bioinformática y bases de datos. Entorno linux, bases de datos
Análisis de secuencias y genomas Alineamiento de secuencias, filogenética molecular, proyectos genoma, anotación de secuencias, ensamblado y predicción de genes
Biología estructural Visualización de macromoléculas, estructura de DNA y RNA, estructura de proteínas y su predicción, predicción de Interacciones proteína-sustrato y proteína-proteína

Planificación
Metodoloxías / probas Horas presenciais Horas non presenciais / traballo autónomo Horas totais
Sesión maxistral 15 22.5 37.5
Prácticas a través de TIC 10 1 11
Foro virtual 0 2 2
Resumo 0 10 10
Proba obxectiva 2 12 14
 
Atención personalizada 0.5 0 0.5
 
*Os datos que aparecen na táboa de planificación son de carácter orientativo, considerando a heteroxeneidade do alumnado

Metodoloxías
Metodoloxías Descrición
Sesión maxistral clases de presentación de contenidos, de ejercicios y de discusión
Prácticas a través de TIC ejercicios en el ordenador
Foro virtual Discusión online
Resumo Informe/memoria razonada sobre los ejercicios prácticos realizados en el ordenador durante la clase (a entregar en las 24 horas siguientes a la clase)
Proba obxectiva Examen sobre contenidos teóricos o prácticos

Atención personalizada
Metodoloxías
Sesión maxistral
Prácticas a través de TIC
Foro virtual
Proba obxectiva
Resumo
Descrición
Se responderá a las cuestiones particulares de cada alumno

Avaliación
Metodoloxías Descrición Cualificación
Proba obxectiva Se realizará una prueba tipo test para evaluar los conocimientos adquiridos durante la realización de las clases magistrales y las prácticas en ordenador 25
Resumo Se evaluará el resumen/informe razonado/memoria sobre los ejercicios prácticos en el ordenador realizados en clase. El resumen/informe/memoria se deberá entregar en las 24 horas siguientes a la clase. 75
 
Observacións avaliación

El examen final de la primera oportunidad se realizará el lunes posterior a la finalización de las clases de la materia.
Tendrán prioridad para obtener MH aquellos alumnos que se evalúen en la primera oportunidad.
En la segunda oportunidad se seguirán los mismos criterios.

Fontes de información
Bibliografía básica

Arthur M. Lesk, Introduction to Bioinformatics, 3ª, 2008

David W. Mount, Bioinformatics. Sequence and genome analysis, 2ª, 2004
Bibliografía complementaria


Recomendacións
Materias que se recomenda ter cursado previamente

Materias que se recomenda cursar simultaneamente

Materias que continúan o temario
Enxeñaría xenética e transxénese/610475101
Xenómica e Proteómica/610475103
Técnicas de aplicación en biotecnoloxía/610475107

Observacións

Dado que parte de la bibliografía recomendada para esta materia se encuentra en inglés, es aconsejable tener conocimientos de esta lengua, por lo menos, a nivel de comprensión de textos escritos.



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