Mestrado Universitario en Bioloxía Molecular , Celular e Xenética
Descriptores
Ciclo
Período
Curso
Tipo
Créditos
Mestrado Oficial
2º cuadrimestre
Primeiro
Optativa
3
Idioma
Castelán
Galego
Inglés
Prerrequisitos
Departamento
Bioloxía Celular e Molecular
Coordinación
Becerra Fernandez, Manuel
Correo electrónico
manuel.becerra@udc.es
Profesorado
Becerra Fernandez, Manuel
Cerdan Villanueva, Maria Esperanza
Lamas Maceiras, Mónica
Correo electrónico
manuel.becerra@udc.es
esper.cerdan@udc.es
monica.lamas@udc.es
Web
Descrición xeral
Dentro del Máster en Biología Molecular, Celular y Genética, esta asignatura, tiene como objetivos conocer y manejar los fundamentos teóricos y las aproximaciones experimentales al análisis de las propiedades físicas y químicas de las macromoléculas biológicas, en especial las proteínas, con el fin de relacionar sus estructuras con su función y actividad biológica. Se estudiarán los conceptos necesarios para la descripción de las estructuras, los métodos computacionales y experimentales utilizados para su estudio y los fundamentos teóricos que los justifican.
Competencias do título
Código
Competencias da titulación
A5
Capacidade de utilizar ferramentas Bioinformáticas a nivel de usuario
A13
Capacidade de comprender a estrutura, e función das proteínas a nivel individual e da proteómica, así como das técnicas necesarias para analizaras e estudar as súas interaccións con outras biomoléculas
B1
Capacidade de análise e síntese de problemas biolóxicos en relación coa Bioloxía Molecular, Celular e Xenética
B2
Capacidade de toma de decisións para a resolución de problemas: que sexan capaces de aplicar os coñecementos teóricos e prácticos adquiridos na formulación de problemas biolóxicos e a busca de solucións
B3
Capacidade de xestión da información: reunir e interpretar datos, información e resultados relevantes, obter conclusións e emitir informes razoados sobre cuestións científicas e biotecnolóxicas
B4
Capacidade de organización e planificación do traballo: que sexan capaces de xestionar a utilización do tempo así como os recursos dispoñibles e organizar o traballo no laboratorio
B5
Correcta comunicación oral e escrita sobre temas científicos na lingua nativa e polo menos noutra lingua de difusión Internacional a través da lectura de artigos científicos e exposición de traballos
B6
Capacidade de traballo en equipo: que sexan capaces de manter relacións interpersoais eficaces nun contexto de traballo interdisciplinar e internacional con respecto á diversidade cultural
B7
Capacidade de progreso persoal: aprender de forma autónoma, adaptarse a novas situacións, desenvolvendo calidades como creatividade, capacidade de liderado, motivación pola excelencia e a calidade
B8
Capacidade de razoamento crítico e compromiso ético coa sociedade: sensibilidade fronte aos problemas bioéticos e aos relacionados coa conservación de recursos naturais
B9
Capacidade de preparación, exposición e defensa dun traballo
C1
Expresarse correctamente, tanto de forma oral coma escrita, nas linguas oficiais da comunidade autónoma.
C2
Dominar a expresión e a comprensión de forma oral e escrita dun idioma estranxeiro.
C3
Utilizar as ferramentas básicas das tecnoloxías da información e as comunicacións (TIC) necesarias para o exercicio da súa profesión e para a aprendizaxe ao longo da súa vida.
C4
Desenvolverse para o exercicio dunha cidadanía aberta, culta, crítica, comprometida, democrática e solidaria, capaz de analizar a realidade, diagnosticar problemas, formular e implantar solucións baseadas no coñecemento e orientadas ao ben común.
C5
Entender a importancia da cultura emprendedora e coñecer os medios ao alcance das persoas emprendedoras.
C6
Valorar criticamente o coñecemento, a tecnoloxía e a información dispoñible para resolver os problemas cos que deben enfrontarse.
C7
Asumir como profesional e cidadán a importancia da aprendizaxe ao longo da vida.
C8
Valorar a importancia que ten a investigación, a innovación e o desenvolvemento tecnolóxico no avance socioeconómico e cultural da sociedade.
Resultados de aprendizaxe
Competencias de materia (Resultados de aprendizaxe)
Competencias da titulación
Capacidad para comprender los conceptos y teorías relacionados con la dinámica de las
proteínas en las células
AI9
BI1 BI2 BI3 BI4 BI5 BI6 BI7 BI8 BI9
CM1 CM2 CM3 CM4 CM5 CM6 CM7 CM8
Familiarización con las fuentes bibliográficas e informáticas donde se puede obtener
información actualizada
AI3
BI3
CM3
Conocer los sistemas para la determinación de estructuras mediante difracción de rayos X
AI9
BI1 BI2 BI3 BI4 BI5 BI6 BI7 BI8 BI9
CM1 CM2 CM3 CM4 CM5 CM6 CM7 CM8
Conocer diferentes programas informáticos para la representación de proteínas y su uso
AI3 AI9
BI1 BI2 BI3 BI4 BI5 BI6 BI7 BI8 BI9
CM1 CM2 CM3 CM4 CM5 CM6 CM7 CM8
Conocer las técnicas para determinar interacciones entre proteínas y de las proteínas con
otras biomoléculas y ligandos
AI9
BI1 BI2 BI3 BI4 BI5 BI6 BI7 BI8 BI9
CM1 CM2 CM3 CM4 CM5 CM6 CM7 CM8
Capacidad de interpretar de modo crítico los datos de una publicación de una estructura de
una proteína
AI9
BI3
CM1 CM2 CM3 CM4 CM5 CM6 CM7 CM8
Contidos
Temas
Subtemas
Clasificación estructural de las proteínas.
Dominios estructurales de las proteínas. Clasificación de las proteínas de acuerdo a su estructura tridimensional. Proteínas alfa. Proteínas alfa/beta. Proteínas beta. Clases estructurales de proteínas. Clasificación CATH. Clasificación SCOP. Clasificación DALI.Clasificación SMART.
Criterios para la elección de un método de purificación y caracterización
preliminar.
Técnicas cromatográficas: de filtración en gel, intercambio iónico, afinidad, interacción hidrofóbica. Estrategias de purificación. Caracterización preliminar de la conformación proteica: Estado de agregación, de compacidad. Estructura secundaria e indicadores de estructura terciaria. Cuantificación de las proteínas.
Determinación experimental de la estructura de
proteínas mediante difracción de rayos X.
Técnicas de cristalización. Herramientas y estrategias para la toma de datos de
difracción. Interpretación de los difractogramas. Obtención y refinamiento del modelo
molecular. Parámetros para calcular la convergencia del modelo. Modelización.
Interacciones entre biomoléculas.
Las
interacciones de las proteínas para la formación de complejos con proteínas y otros ligandos.
Métodos experimentales para determinar estas interacciones y su estructura. El método del doble híbrido. Método de split-ubiquitina. Pull-down. GST-Pull-down. FRET. Ensayos EMSA. Ensayos CHIP. Otras metodologías
Planificación
Metodoloxías / probas
Horas presenciais
Horas non presenciais / traballo autónomo
Horas totais
Sesión maxistral
13
19.5
32.5
Seminario
2
3.6
5.6
Prácticas de laboratorio
4
5.6
9.6
Prácticas a través de TIC
6
8.4
14.4
Proba mixta
1
8.9
9.9
Atención personalizada
3
0
3
*Os datos que aparecen na táboa de planificación son de carácter orientativo, considerando a heteroxeneidade do alumnado
Metodoloxías
Metodoloxías
Descrición
Sesión maxistral
Exposición oral complementada con el uso de medios audiovisuales con la finalidad de transmitir conocimientos y facilitar el aprendizaje.
Seminario
Técnica de trabajo que tiene como finalidad la elaboración de documentos en powerpoint y word sobre un tema propuesto por el profesor.
Prácticas de laboratorio
Metodología que permite al alumnado aprender de forma efectiva, a través de actividades de carácter práctico (demostraciones, simulaciones, etc.) la teoría de un ámbito de conocimiento, mediante la utilización de las tecnologías de la información y las comunicaciones.
Prácticas a través de TIC
Las TIC permiten visualizar modelos de estructura de proteínas y diseñar experimentos de interacción.
Proba mixta
Combinacion de preguntas de opción multiple y preguntas cortas de relación
Atención personalizada
Metodoloxías
Seminario
Prácticas de laboratorio
Prácticas a través de TIC
Descrición
La atención personalizada que se describe en relación a estas metodologías se conciben como momentos de trabajo presencial del alumno con el profesor por lo que implican una participación obligatoria para el alumno.
La forma y el momento en que se desarrollará se indicará en relación a cada actividad a lo largo del curso según el plan de trabajo de la asignatura
Horario de tutorías Pfra. Esperanza Cerdán
martes, miercoles, jueves de 13.00 a 15.00
Avaliación
Metodoloxías
Descrición
Cualificación
Sesión maxistral
Se valorará asistencia y participación activa
5
Seminario
Se evaluará el seminario realizado por el alumno teniendo en cuenta la capacidad para la comprensión de la información y la capacidad para exponer y debatir en grupo.
15
Prácticas de laboratorio
Se evaluará la asistencia regular y la participación activa a las prácticas de laboratorio.
10
Proba mixta
Prueba relativa a conocimientos teóricos y prácticos
50
Prácticas a través de TIC
Se valorará la asistencia y participación activa
20
Observacións avaliación
Podrán optar a MH aquellos alumnos que se evalúen en la primera oportunidad de Junio.
Fontes de información
Bibliografía básica
La bibliografía a utilizar se podrá consultar en la herramienta informatica actualizada de la asignatura
·
Banaszak,
L. J. (2000). Foundations of structural biology. Academic Press.
·
Berg, J.
M., Tymoczko, J. L., Stryer. L. (2003). BIOQUÍMICA. 5ª Edición. Reverté.
·
Branden,
C. & Tooze, J. (1998). INTRODUCTION TO PROTEIN STRUCTURE. 2nd edition
Garland Publishing, Inc, New York.
· Cerdán Villanueva, M.
E. (2005). Curso avanzado de proteínas y ácidos nucleicos. Universidade da Coruña.
·
Creighton,
T. E. (1993). PROTEINS: STRUCTURES AND MOLECULAR PROPERTIES, 2nd edition. W.H.
Freeman & Company, New York.
·
Gómez-Moreno,
C. & Sancho, J. (Coords). (2003). ESTRUCTURA DE PROTEÍNAS. Ariel Ciencia, Barcelona.
·
Lesk, A.
M. (2000). INTRODUCTION TO PROTEIN ARCHITECTURE. THE STRUCTURAL BIOLOGY OF
PROTEINS. OxfordUniversity Press, Oxford.
·
Nelson, D. L., Cox, M.
M. (2000). LEHNINGER PRINCIPLES OF BIOCHEMISTRY.
Worth Publishers.
Rodes,
G. (2000). Crystallography. Made Crystal Clear. Academic Press.