| Competencias del título |
| Código | Competencias de la titulación |
| A3 | Capacidad de utilizar técnicas e instrumentos habituales en la investigación biológica celular y molecular: que sean capaces de manejar las técnicas y protocolos así como comprender las potenciales de las mismas, sus usos y aplicaciones. |
| A5 | Capacidad de comprender el funcionamiento celular a través de su organización estructural, señalización bioquímica, expresión génica y variabilidad genética. |
| A15 | Capacidad de utilizar herramientas Bioinformáticas a nivel de usuario. |
| B1 | Capacidad de análisis y síntesis de problemas biológicos en relación con la Biología Molecular, Celular y Genética. |
| B2 | Capacidad de gestión de la información: que sean capaces de reunir e interpretar datos, información y resultados relevantes, obtener conclusiones y emitir informes razonados sobre cuestiones científicas y biotecnológicas. |
| B3 | Capacidad de toma de decisiones para la resolución de problemas: que sean capaces de aplicar los conocimientos teóricos y prácticos adquiridos en la formulación de problemas biológicos y la búsqueda de soluciones. |
| B5 | Correcta comunicación oral y escrita sobre temas científicos en la lengua nativa y al menos en otra lengua de difusión Internacional. |
| B9 | Capacidad de preparación, exposición y defensa de un trabajo. |
| C2 | Dominar la expresión y la comprensión de forma oral y escrita de un idioma extranjero. |
| C3 | Utilizar las herramientas básicas de las tecnologías de la información y las comunicaciones (TIC) necesarias para el ejercicio de su profesión y para el aprendizaje a lo largo de su vida. |
| C8 | Valorar la importancia que tiene la investigación, la innovación y el desarrollo tecnológico en el avance socioeconómico y cultural de la sociedad. |
| Resultados de aprendizaje | |||
| Competencias de materia (Resultados de aprendizaje) | Competencias de la titulación | ||
| Utilizar herramientas moleculares para el conocimiento del genoma de diversos organismos | AI1 AI11 |
BI1 BI5 |
CM2 CM3 |
| Comprender el estado actual del conocimiento en el campo de la genómica estructural, funcional y evolutiva | AI1 AI11 |
BI1 BI5 BI9 |
CM2 CM3 CM8 |
| Comprender los mecanismos de evolución de los genomas y de las herramientas moleculares y bioinformáticas para su estudio | AI1 AI3 AI11 |
BI1 BI5 BI9 |
CM2 |
| Diseñar, interpretar y analizar experimentos y datos de microarrays de ADN | AI1 AI3 AI11 |
BI1 BI2 BI3 |
CM3 |
| Contenidos |
| Tema | Subtema |
| Organización de genomas: | Genomas procariotas y eucariotas. Tamaño genómico y valor C. Familias génicas. ADN repetitivo. Genomas de organismos modelo. Genomas organulares. Genómica evolutiva. |
| Técnicas: | Estrategias e metodologías de secuenciación. Análisis de ligamiento. Cartografiado físico. Ensamblaje de secuencias. Anotación de genes. Microarrays de ADN: metodología, tipos de plataformas, diseño experimental, análisis de datos. |
| Bioinformática: | Bases de datos y proyectos genómicos a gran escala. Herramientas para la comparación de genomas. Análisis de expresión génica e microarrays. Programas de clustering y análisis de correspondencia. |
| Planificación | |||
| Metodologías / pruebas | Horas presenciales | Horas no presenciales / trabajo autónomo | Horas totales |
| Sesión magistral | 10 | 18.62 | 28.62 |
| Presentación oral | 5 | 3 | 8 |
| Eventos científicos y/o divulgativos | 1 | 3 | 4 |
| Prácticas a través de TIC | 10 | 20 | 30 |
| Prueba objetiva | 2 | 0 | 2 |
| Atención personalizada | 2.38 | 0 | 2.38 |
| (*)Los datos que aparecen en la tabla de planificación són de carácter orientativo, considerando la heterogeneidad de los alumnos | |||
| Metodologías |
| Metodologías | Descripción |
| Sesión magistral | Exposición oral complementada con el uso de medios audiovisuales con el fin de transmitir conocimientos y facilitar el aprendizaje. |
| Presentación oral | Cada estudiante debe sintetizar en un máximo de 15 minutos el contenido de un artículo de revisión asignado por el profesorado con suficiente antelación. |
| Eventos científicos y/o divulgativos | El alumnado debe asistir a la conferencia pronunciada por un especialista en genómica. El profesorado facilitará con suficiente antlación un artículo relacionado con el tema de la conferencia que, se espera, sirva como base de las preguntas al ponente. |
| Prácticas a través de TIC | Las TIC constituyen un excelente soporte y canal para el tratamiento de la información y la aplicación práctica de conocimientos, facilitando así la comunicación y aprendizaje. |
| Prueba objetiva | Proba escrita utilizada para la evaluación del aprendizaje y que puede combinar distintos tipos de preguntas. |
| Atención personalizada |
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| Evaluación | ||
| Metodologías | Descripción | Calificación |
| Sesión magistral | Asistencia y participación activa. |
10 |
| Presentación oral | Capacidad de síntesis, habilidades de comunicación. A través de esta actividad se evaluará la adquisición de las competencias A1, A11, B1, B5, B9. |
20 |
| Prácticas a través de TIC | Asistencia y participación activa. Memoria de prácticas: capacidad de síntesis y redacción. A través de esta actividad se evaluará la adquisición de las competencias A1, A3, A11, B1, B2, B3. |
20 |
| Prueba objetiva | El examen escrito evaluará los conocimientos adquiridos durante las actividades anteriormente mencionadas, así como las siguientes competencias: A1, A11, B1 y B3. | 40 |
| Eventos científicos y/o divulgativos | Asistencia y participación en el turno de preguntas. A través de esta actividad se evaluará la adquisición de las competencias A1, A11, B1, B5. |
10 |
| Observaciones evaluación | ||
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Podrá optar a Matrícula de Honor el alumnado evaluado en la primera oportunidad (junio). |
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| Fuentes de información |
| Básica |
McLachlan, G. J., Do, K-A., Ambroise, C (2004). Analyzing Microarray Gene Expression Data. Wiley-Interscience. John Wiley & Sons
Bowtell, D., Sambrook, J. (2003). DNA Microarrays. Cold Spring Harbor Laboratory Press.
Allison, David B., et al (2006). DNA microarrays and related genomics techniques design, analysis, and interpretation of experiments. Chapman & Hall/CRC
E. Rinaldis, A. Lahm. (2007). DNA microarrays: current applications. Wymondham: Horizon Bioscience
Mushegian, Arcady R. (2007). Foundations of comparative genomics. Academic Press
Hunt. S. P., Livesey, R. (2001). Functional genomics. A practical approach. Oxford University Press
Brown, Terry A. (2008). Genomas. Médica Panamericana
Sussman, Hillary E. y Smit, María (2006). Genomes. Cold Spring Harbor Laboratory Press
Meyers, Robert A. (2007). Genomics and genetics : from molecular details to analysis and techniques. Wiley-VCH
Gregory, T. Ryan (2005). The evolution of the genome. Elsevier Academic Press
Lynch, Michael (2007). The origins of genome architecture. Sinauer Associates |
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| Complementária |
Straalen, Nico M. van (2006). An introduction to ecological genomics. Oxford University Press
Zhanjiang, Liu (2007). Aquaculture genome techonologies. Blackwell
Futuyama, Douglas J. (2006). Evolution. Sinauer Associates
Dale Jeremy (2008). From genes to genomes: concepst and applications of DNA technology. John Wiley & Sons
Sensen, Christoph W. (2005). Handbook of genome research genomics, proteomics, metabolism, bioinformatics, ethical & legal issues . Wiley-VCH |
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RECURSOS EN INTERNET:
DOE Joint Genome Institut. Why sequence them? EMBL (European Molecular BIology Laboratory), Bioinformatics. ExPASy (Expert Protein Analysis System). GeneMark: GenomeNet (Kyoto University Bioinformatics Center). Genoscope. Le séquençage des génomes. GOLD (Genomes Online Database). Human genome: advanced annotation tutorial. http://www.mad-cow.org/00/annotation_tutorial.html Human Genome Project Information. http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/home.shtml Iañez Pareja, E. (1997). Introducción a los Proyectos Genoma. KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes). Nacional Human Genome Research Institute: NCBI (National Center for Biotechnology Information). The Sanger Institute. TIGR (The Institute for Genomic Research). tRNAscan-SE 1.21. The WWW Virtual Library: Model Organisms: ALGUNAS BASES DE DATOS DE MICROARRAYS DE ADN ArrayExpress http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/ ChipDB http://staffa.wi.mit.edu/chipdb/public/ ExpressDB http://twod.med.harvard.edu/ExpressDB/ Gene Expression Omnibus (GEO) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ READ (RIKEN cDNA Expression Array Database) http://read.gsc.riken.go.jp/ Saccharomyces Genome Database (SGD) http://genome-www4.Stanford.EDU/cgi-bin/SGD/expression/expressionConnection.pl Standford Microarray Database ( SMD) http://genome-www5.stanford.edu/ The Yale Microarray Database http://www.med.yale.edu/microarray/ yeast Microarray Global Viewer (yMGV) http://www.transcriptome.ens.fr/ymgv/ |
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