Datos Identificativos 2014/15
Asignatura (*) Xenómica e Proteómica Código 610475103
Titulación
Mestrado Universitario en Biotecnoloxía Avanzada
Descriptores Ciclo Período Curso Tipo Créditos
Mestrado Oficial 1º cuadrimestre
Primeiro Obrigatoria 4.5
Idioma
Castelán
Galego
Inglés
Prerrequisitos
Departamento Bioloxía Celular e Molecular
Matemáticas
Coordinación
Lamas Maceiras, Mónica
Correo electrónico
monica.lamas@udc.es
Profesorado
Lamas Maceiras, Mónica
Lopez de Ullibarri Galparsoro, Ignacio
Correo electrónico
monica.lamas@udc.es
ignacio.lopezdeullibarri@udc.es
Web http://webs.uvigo.es/masterbiotecnoloxiaavanzada/
Descrición xeral EN LA DOCENCIA DE LA MATERIA PARTICIPAN TAMBIÉN LOS SIGUIENTES PROFESORES DE LA UVIGO:
Ana Gago Martínez (e-mail: anagago@uvigo.es)
José Manuel Leao Martins (e-mail: leao@uvigo.es)
Y EL SIGUIENTE PROFESOR DEL INIBIC (INSTITUTO DE INVESTIGACIÓN BIOMÉDICA DE A CORUÑA):
Jesús Mateos Martín (e-mail: Jesus.Mateos.Martin@sergas.es)

Comprender las bases de la Genómica y la proteómica de cara a su aplicación en el ámbito de la biotecnología

Competencias do título
Código Competencias da titulación
A4 Coñecer e saber usar as técnicas de cultivo e a enxeñaría celular.
A5 Coñecer os principios da xenómica e a proteómica.
A6 Coñecer e saber aplicar en biotecnoloxía técnicas convencionais, instrumentais así como tecnoloxías como a nanotecnoloxía e teledetección.
A7 Saber buscar, obter e interpretar a información das bases de datos biolóxicos: xenómicas, proteómicas, transcriptómicas e metabolómicas e utilizar as ferramentas básicas da bioinformática.
B1 Capacidade de análise e síntese (localización de problemas e identificación das causas e a súa tipoloxía).
B2 Capacidade de organización e planificación de todos os recursos (humanos, materiais, información e infraestruturas).
B3 Capacidade de xestión da información (con apoio de tecnoloxías da información e as comunicacións).
B5 Capacidade de identificar problemas, buscar solucións e aplicalas nun contexto biotecnolóxico profesional ou de investigación.
B13 Aprendizaxe autónoma.
C1 Expresarse correctamente, tanto de forma oral coma escrita, nas linguas oficiais da comunidade autónoma.
C2 Dominar a expresión e a comprensión de forma oral e escrita dun idioma estranxeiro.
C3 Utilizar as ferramentas básicas das tecnoloxías da información e as comunicacións (TIC) necesarias para o exercicio da súa profesión e para a aprendizaxe ao longo da súa vida.
C8 Valorar a importancia que ten a investigación, a innovación e o desenvolvemento tecnolóxico no avance socioeconómico e cultural da sociedade.

Resultados de aprendizaxe
Competencias de materia (Resultados de aprendizaxe) Competencias da titulación
Coñecer os protocolos de uso das diferentes técnicas AM4
Coñecer as aplicacións das distintas técnicas AM4
AM6
Establecer relacións de uso entre as distintas técnicas e a sua posible combinación para a resolución de problemas AM4
AM6
BM1
BM5
Interpretar os datos procedentes das observacións e medidas no laboratorio AM6
AM7
BM1
BM13
CM8
Planificar, deseñar e desenrolar experimentos en relación coas técnicas aprendidas AM4
AM5
AM6
BM1
BM2
BM5
CM1
CM8
Familiarización con revistas científicas, con bases de datos de secuencias, con programas de análise e con ferramentas biotecnolóxicas AM7
BM1
BM3
CM3
Capacidade de análise e crítica de traballos de investigación, publicados en revistas científicas internacionais AM7
BM1
BM3
BM13
CM2
Coñecer os principios da xenómica e a proteómica AM5
BM1
BM13

Contidos
Temas Subtemas
1.Bloque: Xenómica
Tema 1. Introducción a xenómica: bases, conceptos e técnicas.
Tema 2. Proxectos “xenoma”.
Tema 3. Transcritómica: Microoarrays e Microchips: Microrrays de DNA (metodoloxía, tipos de plataformas, deseño experimental, análisis dos datos).
Tema4. PCR cuantitativa en tempo real: metodoloxía e aplicacion para a detección de microorganismos, análisis de mutacion e de expresión xénica en microorganismos.
Tema 5. Xenómica estructural e funcional.
2. Bloque: Proteómica Tema 1. Técnicas de estudo de proteínas: Preparación de extractos proteicos.
Tema 2. Electroforese mono e bidimensional de proteínas.
Tema 3. Electroforese capilar mediante isoelectroenfoque.
Tema 4. Técnicas inmunolóxicas de análise de proteínas.
Tema 5. Tecnicas cromatográficas (Exclusión molecular, Afinidade, IMAC, Intercambio iónico, Hidrofóbica).
Tema 6. Espectrometría de masas (MALDI-TOF, É) Identificación de proteínas mediante pegada peptídica.
Tema 7. Espectrometría de masas en tándem (MS/MS): secuenciación de péptidos.
Tema 8. Modificacións post-traduccionales.
Tema9. Análise de complexos proteicos.Chips de proteínas.
Tema 10. Proteómica de expresión diferencial en xel, DIGE e Proteómica de expresión sen xel: ICAT, iTRAQ, SILAC

Planificación
Metodoloxías / probas Horas presenciais Horas non presenciais / traballo autónomo Horas totais
Prácticas de laboratorio 12.5 12.5 25
Sesión maxistral 25 50 75
Proba mixta 2 4 6
Traballos tutelados 0 4.5 4.5
 
Atención personalizada 2 0 2
 
*Os datos que aparecen na táboa de planificación son de carácter orientativo, considerando a heteroxeneidade do alumnado

Metodoloxías
Metodoloxías Descrición
Prácticas de laboratorio Clases prácticas no laboratorio, na aula de informática, resolución de problemas e casos prácticos
Sesión maxistral Impartidas polo profesor ou/e exposición de traballos do alumno
Proba mixta Exámenes con cuestións sobre os contidos teóricos e prácticos
Traballos tutelados Traballos e/ou resolución de cuestionarios relacionados con algún aspecto da asignatura. Realizaránse de maneira individual ou en grupo baixo a orientación do profesor.

Atención personalizada
Metodoloxías
Traballos tutelados
Descrición
Tutorías personalizadas centradas na orientación para a realización de traballos ou resolución de dubidas sobre os contidos das materias

Avaliación
Metodoloxías Descrición Cualificación
Proba mixta Consistirá nun exámen con cuestions nas que o alumno terá que aplicar os coñecementos teóricos e prácticos adquiridos na asignatura
60
Prácticas de laboratorio Valorarase o traballo nas diferentes sesións de prácticas e a resolución problemas 30
Traballos tutelados Redacción de traballos e/ou resolución de cuestionarios 10
 
Observacións avaliación

O exame final da primeira oportunidade, coincidirá co luns seguinte á finalización da materia.

O 50 % da nota correspondera a parte de Xenomica e o outro 50 % a Proteomica.

Os alumnos realizaran dous traballos tutelados un de Xenomica e outro de Proteomica, suporán un 10 % da nota

A hora de conceder as matrículas de honra darase prioridade aos alumnos que acadaran as máximas calificacións na primeira oportunidade


Fontes de información
Bibliografía básica Mackay, I. M. (2007). Real-time PCR in microbiology : from diagnosis to characterisation . Norfolk: Caister Academic Press.
Edwards, K., Logan J. & Saunders, N. (2004). Real-time PCR: an essential guide. . Horizon bioscien
Andreas Manz, Nicole Pamme y Dimitri Lossifidis (2004). Bioanalytical Chemistry . Imperial College Press
Luque, J. & Herráez, A. (2001). Biología Molecular e Ingeniería Genética. Harcourt
Voet, D., Voet, J. & Voet, C. W. (2007). Fundamentos de bioquímica. Medica paramericana
Hartwell, L. (2008). Genetics: from genes to genome. McGrawhill
Richard J. Simpson, (2003). Proteins and Proteomics: A laboratory manual. CSHL Press
Speed, T. (2003). Statistical Analysis of Gene Expression Microarray Data. Chapman & Hall/CRC

Bibliografía complementaria Recursos web (). Bioconductor, http://www.bioconductor.org/.
Gentleman, R., Carey, V. J., Huber, W., Irizarry, R. A. & Dudoit, S. (2005). Bioinformatics and Computational Biology Solutions using R and Bioconductor. Springer
Recurso web (). http://genomebiology.com/2004/5/10/R80.
Recurso web (). Página web de R: http://www.r-project.org/.
García Miranda, C. M. (1997). Perspectiva ética y jurídica del proyecto Genoma Humano. UDC


Recomendacións
Materias que se recomenda ter cursado previamente
Bioinformática/610475104

Materias que se recomenda cursar simultaneamente

Materias que continúan o temario
Enxeñaría xenética e transxénese/610475101
Enxeñaria Celular e Tisular/610475102
Técnicas de aplicación en biotecnoloxía/610475107

Observacións
Dado que parte da bibliografía recomendada para esta materia atópase en inglés, e recomendable ter coñecementos desta lengua, polo menos, a nivel de comprensión de textos escritos.


(*)A Guía docente é o documento onde se visualiza a proposta académica da UDC. Este documento é público e non se pode modificar, salvo casos excepcionais baixo a revisión do órgano competente dacordo coa normativa vixente que establece o proceso de elaboración de guías