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Facultad de Ciencias
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Mestrado Universitario en Bioloxía Molecular , Celular e Xenética
 Asignaturas
  Dinámica y Estructura de Proteínas
   Contenidos
Tema Subtema
Clasificación estructural de las proteínas.
Dominios estructurales de las proteínas. Clasificación de las proteínas de acuerdo a su estructura tridimensional. Proteínas alfa. Proteínas alfa/beta. Proteínas beta. Clases estructurales de proteínas. Clasificación CATH. Clasificación SCOP. Clasificación DALI.Clasificación SMART.
Criterios para la elección de un método de purificación y caracterización
preliminar.

Técnicas cromatográficas: de filtración en gel, intercambio iónico, afinidad, interacción hidrofóbica. Estrategias de purificación. Caracterización preliminar de la conformación proteica: Estado de agregación, de compacidad. Estructura secundaria e indicadores de estructura terciaria. Cuantificación de las proteínas.
Determinación experimental de la estructura de
proteínas mediante difracción de rayos X.

Técnicas de cristalización. Herramientas y estrategias para la toma de datos de
difracción. Interpretación de los difractogramas. Obtención y refinamiento del modelo
molecular. Parámetros para calcular la convergencia del modelo. Modelización.
Interacciones entre biomoléculas. Las interacciones de las proteínas para la formación de complejos con proteínas y otros ligandos.
Métodos experimentales para determinar estas interacciones y su estructura. El método del doble híbrido. Método de split-ubiquitina. Pull-down. GST-Pull-down. FRET. Ensayos EMSA. Ensayos CHIP. Otras metodologías
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