Study programme competencies |
Code
|
Study programme competences / results
|
A8 |
CE8 - Understanding the basis of the information of the hereditary material, its transmission, analysis and evolution |
A9 |
CE9 – To understand the benefits and the problems associated with the sequencing and the use of biological sequences, as well as knowing the structures and techniques for their processing |
B1 |
CB6 - Own and understand knowledge that can provide a base or opportunity to be original in the development and/or application of ideas, often in a context of research |
B2 |
CB7 - Students should know how to apply the acquired knowledge and ability to problem solving in new environments or little known within broad (or multidisciplinary) contexts related to their field of study |
B5 |
CB10 - Students should possess learning skills that allow them to continue studying in a way that will largely be self-directed or autonomous. |
B6 |
CG1 -Search for and select the useful information needed to solve complex problems, driving fluently bibliographical sources for the field |
B7 |
CG2 - Maintain and extend well-founded theoretical approaches to enable the introduction and exploitation of new and advanced technologies |
B8 |
CG3 - Be able to work in a team, especially of interdisciplinary nature |
C1 |
CT1 - Express oneself correctly, both orally writing, in the official languages of the autonomous community |
C2 |
CT2 - Dominate the expression and understanding of oral and written form of a foreign language |
C3 |
CT3 - Use the basic tools of the information technology and communications (ICT) necessary for the exercise of their profession and lifelong learning |
C7 |
CT7 – To maintain and establish strategies for scientific updating as a criterion for professional improvement. |
C8 |
CT8 - Rating the importance that has the research, innovation and technological development in the socio-economic and cultural progress of society |
Learning aims |
Learning outcomes |
Study programme competences / results |
Análise xenética mendeliana estudando o xene como unidade da herdanza |
AJ8
|
BJ1 BJ2 BJ5 BJ6 BJ7 BJ8
|
CJ1 CJ2 CJ3 CJ7 CJ8
|
Estudar a base cromosómica da herdanza, a determinación do sexo, herdanza extranuclear e o ligamento e recombinación xénica. |
AJ8 AJ9
|
BJ1 BJ2 BJ5 BJ6 BJ7 BJ8
|
CJ1 CJ2 CJ3 CJ7 CJ8
|
Estudar os cambios no material xenético |
AJ8 AJ9
|
BJ1 BJ2 BJ5 BJ6 BJ7 BJ8
|
CJ1 CJ2 CJ3 CJ7 CJ8
|
Estudo da xenética das poboacións. |
AJ8 AJ9
|
BJ1 BJ2 BJ5 BJ6 BJ7 BJ8
|
CJ1 CJ2 CJ3 CJ7 CJ8
|
Contents |
Topic |
Sub-topic |
Tema 1. ANALISE XENÉTICA MENDELIANA. |
Os experimentos de Mendel: cruzamentos de monohíbridos e dihíbridos. Concepto de xenotipo e fenotipo. Terminoloxía e simboloxía. Análise de pedigrís.
|
Tema 2. BASE CROMOSÓMICA DA HERDANZA E DETERMINACIÓN DO SEXO. |
Significado xenético da mitosis e a meiosis. Teoría cromosómica da herdanza. Determinación do sexo. Herdanza ligada ao sexo. |
Tema 3. EXTENSIONES DA ANALISE XENÉTICA MENDELIANA. |
Modificacións da dominancia. Alelismo múltiple. Letalidade. Penetrancia e expresividade. Pleiotropía. Epistase e interacción xénica. |
Tema 4. HERDANZA EXTRANUCLEAR. |
Efecto materno. Herdanza materna. Heteroplasmia. |
Tema 5. LIGAMENTO E RECOMBINACIÓN EN EUCARIOTAS. |
Ligamento e recombinación dos xenes nos cromosomas. Mapas de ligamento. Interferencia e coeficiente de coincidencia. Función de mapa: relación entre a distancia de mapa real e a frecuencia de recombinación. |
Tema 6. LIGAMENTO E RECOMBINACIÓN EN BACTERIAS E VIRUS. |
Transformación bacteriana. Conxugación: plásmidos e episomas sexuais. Transducción xeralizada e especializada. |
Tema 7. ORGANIZACIÓN DO MATERIAL XENÉTICO NOS CROMOSOMAS. |
Compoñentes do cromosoma eucariota. Paradoxa do valor C. Centrómeros e telómeros. O cariotipo. Secuencias únicas e secuencias repetidas. Familias xénicas. Mapas físicos e xenéticos. |
Tema 8. A MUTACIÓN. |
Mutación aleatoria e adaptativa. Tipos de mutacions. Mutación espontánea e inducida. |
Tema 9. A MUTACIÓN CROMOSÓMICA (I): CAMBIOS NA ESTRUTURA DOS CROMOSOMAS. |
Delecións. Duplicacións. Inversións. Translocacións. Fusións e disociacións robertsonianas. |
Tema 10. A MUTACIÓN CROMOSÓMICA (II): CAMBIOS NO NÚMERO DOS CROMOSOMAS. |
Euploidías e aneuploidías. Monoploidías. Poliploidías: autopoliploidía e alopoliploidía. Aneuploidías: non disxunción meiótica, monosomías, trisomías. |
Tema 11. MECANISMO MOLECULAR DA RECOMBINACIÓN |
Papel da recombinación xenética. Conversión xénica. Recombinación dos xenes de inmunoglobulinas. |
Tema 12. ELEMENTOS XENÉTICOS TRANSPOÑIBLES |
Elementos xenéticos transpoñibles. Significado evolutivo. |
Tema 13. POBOACIÓNS E ESPECIES |
Concepto de poboación mendeliana. Poboación ideal. Consecuencias do apareamiento aleatorio sobre as frecuencias xénicas e xenotípicas: equilibrio Hardy Weinberg Castle. Consecuencias do apareamiento non aleatorio: efecto Wahlund; consanguinidade; apareamiento clasificado. Fluxo xénico: modelo continente illa. Concepto biolóxico de especie. Evolución dos xenes e as especies: teoría da coalescencia; relacións de polifilia, parafilia e monofilia recíproca entre as especies. Concepto filoxenético de especie. |
Tema 14. MEDIDAS DA VARIACIÓN XENÉTICA |
Polimorfismo xenético: heterocigosidade; diversidade nucleotídica; número de alelos; número de lugares nucleotídicos segregantes; alelos privados; SNPs. Estrutura xenética das poboacións: coeficientes F de Wright; illamento por distancia. Tamaño efectivo das poboacións. Deriva xenética aleatoria. Parámetros poblacionales de mutación e de recombinación. Efecto das fluctuaciones do tamaño poblacional sobre a variación xenética: análise da variación alélica; análise da distribución de "mismatches". Recombinación: grupos de ligamento; efecto aleatorizante da recombinación; desequilibrio gamético; haplotipos. Efectos da selección sobre a variación xenética: "autostop" xenético; selección de fondo; varridos selectivos; efectos Hill Robertson. |
Tema 15. EVOLUCIÓN MOLECULAR |
Niveis de evolución molecular: xenomas de ADN; xenomas de ARN; xenomas de mitocondrias e cloroplastos; proteínas e dominios proteicos; máquinas moleculares. ADN codificante e non codificante: o proxecto ENCODE; sesgos no uso de codones; sesgos na composición nucleotídica; firmas xénicas. Modelos de evolución nucleotídica do ADN: frecuencias nucleotídicas; taxas de transición e transversión; heteroxeneidade das taxas de sustitución por posición; posicións invariantes; reloxos moleculares. Inserciones e deficiencias nucleotídicas: micro e mini satélites; palíndromes; elementos transponibles; duplicaciones segmentales. Reordenaciones cromosómicas: relacións de sintenia entre xenomas de distintas especies. |
Tema 16. XENES ORTÓLOGOS E PARÁLOGOS |
Orixe de novos xenes: duplicación génica; retroposición; barallado de exones (exon shuffling). Isoformas. Familias e superfamilias multigénicas: de secuencia simple (satélites); multiplicacionales (rDNA, tDNA, histonas); informativas (hemoglobinas, anticorpos); "flowers" no xenoma humano. Evolución concertada: patróns; entrecruzamiento desigual; conversión xénica. Evolución por procesos de morte e nacemento. Evolución modular. |
Tema 17. RECONSTRUCIÓN FILOXENÉTICA |
Cladogramas e filogramas. Alineamiento de secuencias. Filtrado de alineamientos con Gblocks. Árbores e redes de xenes. Árbores baseadas en distancias. Árbores de máxima parsimonia. Árbores de máxima verosimilitud. Árbores bayesianos. Redes MP e MJ. Concepto e uso de "outgroups" nas reconstrucións filoxenéticas. Reconstrución de secuencias ancestrales. Datación dos nodos. Apoio estatístico dos nodos internos dunha filoxenia: politomías. Filoxenias en estrela. Incongruencias entre os arboles de xenes e as árbores de especies. A árbore evolutiva da especie humana. |
Planning |
Methodologies / tests |
Competencies / Results |
Teaching hours (in-person & virtual) |
Student’s personal work hours |
Total hours |
ICT practicals |
A8 A9 B1 B5 B6 B7 B8 C2 C3 C7 C8 |
21 |
31.5 |
52.5 |
Student portfolio |
A8 A9 B2 B5 B6 B8 C1 C2 C3 C7 C8 |
0 |
16.5 |
16.5 |
Objective test |
A9 A8 B1 B2 B5 B6 B7 B8 C1 C2 C3 C7 C8 |
4 |
0 |
4 |
Guest lecture / keynote speech |
A8 A9 B1 B5 B6 C1 C2 C7 C8 |
21 |
52.5 |
73.5 |
|
Personalized attention |
|
3.5 |
0 |
3.5 |
|
(*)The information in the planning table is for guidance only and does not take into account the heterogeneity of the students. |
Methodologies |
Methodologies |
Description |
ICT practicals |
As clases prácticas comprenderán unha base explicativa por parte do profesor sobre a base conceptual e obxectivos a acadar e o desenvolvemento de tarefas por parte do alumno. |
Student portfolio |
Os traballos tutelados consistirán na resolución de boletíns de problemas e cuestións, así coma na elaboración de traballos relacionados con algún aspecto da materia. |
Objective test |
A proba mixta consistirá en preguntas curtas, de tipo test e/ou resolución de problemas. Si así se considerase polo profesorado, se podería facilitar a consulta dos seus materiais de apoio por parte do alumnado para responde ás preguntas. |
Guest lecture / keynote speech |
Nas clases maxistrais o profesor explicará os contidos fundamentais de cada tema do programa e sinalará as actividades asociadas a este. Estas incluirán a consulta de bibliografía, a resolución de boletíns de cuestións e problemas, ou a eleboración dun traballo que o alumno deberá elaborar en grupo ou individualmente. |
Personalized attention |
Methodologies
|
Guest lecture / keynote speech |
ICT practicals |
Student portfolio |
|
Description |
Realizaranse titorías de forma individualizada ou en grupo. As titorías centraranse na resolución de dúbidas, así como en proporcionar orientación sobre a realización de actividades programadas. |
|
Assessment |
Methodologies
|
Competencies / Results |
Description
|
Qualification
|
ICT practicals |
A8 A9 B1 B5 B6 B7 B8 C2 C3 C7 C8 |
Realización de varios exercicios de xenética cun ordenador persoal, empregando os programas informáticos utilizados nas prácticas. É imprescindible obter polo menos 12 puntos nesta proba para aprobar a materia.
|
20 |
Student portfolio |
A8 A9 B2 B5 B6 B8 C1 C2 C3 C7 C8 |
Valorarase o grao de comprensión do tema tratado, a capacidade de análise e síntese, a bibliografía consultada e a claridade da exposición ou redacción. No caso de boletíns de cuestións e problemas valorarase a capacidade de razoamento e de achegar solucións. Non será indispensable aprobar os traballos tutelados para aprobar o conxunto da materia. |
20 |
Objective test |
A9 A8 B1 B2 B5 B6 B7 B8 C1 C2 C3 C7 C8 |
Na proba mixta valorarase o dominio e comprensión de conceptos teóricos, claridade expositiva, capacidade de relacionar e integrar a información xenética tratada nas clases de teoría e seminarios, e capacidade de resolver cuestións e problemas. A parte práctica valorarase cun 20% mentras que a teórica representará un 40%. |
60 |
|
Assessment comments |
Para aprobar a materia cómpre acadar unha puntuación de 35/100 no conxunto da proba obxetiva. Si a
suma dos diferentes items é superior a 50% pero non alcanzou o 35/100
sinalado anteriormetne na cualificación final figurará un 4.5 Considerarase NON PRESENTADO cando o alumno non realice NINGUNHA das actividades avaliables.
|
Sources of information |
Basic
|
|
Fontdevila, A., y Moya, A. (2003). Evolución: Origen,
Adaptación y Divergencia de las Especies. Síntesis Fontdevila, A., y Moya, A. (2007). Introducción a la
Genética de Poblaciones. . Síntesis Freeman,
S., and Herron, J. D. (2007). Evolutionary Analysis. . Prentice Hall Futuyma, D.
(2006). Evolutionary Biology. Sinauer Hamilton,
M. (2009). Population Genetics. Wiley-Blackwell Hartl, D.L.
and Clarck, A.G. (2007). Principles of Population Genetics. Sinauer Associates Hedrick,
P.W. (2010). Genetics of Populations.. Jones & Bartlett Lemey, P.,
Salemi, M., and Vandamme, A-M (2009). The Phylogenetic Handbook. Cambridge
University Press Russell PJ
(2010) iGenetics. A Molecular Approach. 3rd edition. Pearson
International Edition Zimmer, C.
and Emlen, D. (2012). Evolution: Making sense of life. Roberts and Company
Publishers |
Complementary
|
|
|
Recommendations |
Subjects that it is recommended to have taken before |
|
Subjects that are recommended to be taken simultaneously |
|
Subjects that continue the syllabus |
|
|