Mestrado Universitario en Bioloxía Molecular , Celular e Xenética
Descriptores
Ciclo
Periodo
Curso
Tipo
Créditos
Máster Oficial
2º cuatrimestre
Primero
Optativa
3
Idioma
Castellano
Gallego
Inglés
Modalidad docente
Presencial
Prerrequisitos
Departamento
Bioloxía
Coordinador/a
Vila Taboada, Marta
Correo electrónico
marta.vila.taboada@udc.es
Profesorado
Vila Taboada, Marta
Correo electrónico
marta.vila.taboada@udc.es
Web
Descripción general
Denomínase xenómica ao estudo integral do funcionamento, evolución e orixe dos xenomas. A xenómica utiliza coñecementos derivados de distintas disciplinas como xenética, bioloxía molecular, bioquímica, informática, estatística, matemáticas e física.
A diferenza da xenética clásica que a partires dun fenotipo (xeralmente mutante) procura o xene ou xenes responsables dese fenotipo, a xenómica ten como obxectivo predicir a función dos xenes a partir da súa secuencia ou das súas interaccións con outros xenes.
As denominadas ciencias ómicas están na vangarda da ciencia, feito debido ás posibilidades abertas polas novas tecnoloxías de secuenciación masiva, aos avances en bioinformática e aos algoritmos cada vez máis sofisticados para análise de xenomas completos.
Competencias del título
Código
Competencias / Resultados del título
A3
Capacidad de utilizar herramientas Bioinformáticas a nivel de usuario.
A11
Capacidad de comprender la estructura, función y evolución de los genomas y aplicar las herramientas necesarias para su estudio.
B1
Capacidad de análisis y síntesis de problemas biológicos en relación con la Biología Molecular, Celular y Genética.
B5
Correcta comunicación oral y escrita sobre temas científicos en la lengua nativa y al menos en otra lengua de difusión Internacional.
B9
Capacidad de preparación, exposición y defensa de un trabajo.
C2
Dominar la expresión y la comprensión de forma oral y escrita de un idioma extranjero.
C3
Utilizar las herramientas básicas de las tecnologías de la información y las comunicaciones (TIC) necesarias para el ejercicio de su profesión y para el aprendizaje a lo largo de su vida.
C8
Valorar la importancia que tiene la investigación, la innovación y el desarrollo tecnológico en el avance socioeconómico y cultural de la sociedad.
Resultados de aprendizaje
Resultados de aprendizaje
Competencias / Resultados del título
Utilizar herramientas moleculares para el conocimiento del genoma de diversos organismos
AI3 AI11
CM3
Comprender el estado actual del conocimiento en el campo de la genómica estructural, funcional y evolutiva
AI3 AI11
BI1 BI5 BI9
CM2 CM8
Comprender los mecanismos de evolución de los genomas y de las herramientas moleculares y bioinformáticas para su estudio
AI3 AI11
BI1 BI5 BI9
CM2 CM8
Diseñar, interpretar y analizar experimentos y datos de microarrays de ADN
AI3 AI11
Contenidos
Tema
Subtema
El Proyecto Genoma Humano
Historia y resultados
Next Generation Sequencing (NGS)
Plataformas
Generalidades sobre el tratamiento de datos
Genómica estructural
Anotación
Diagnóstico clínico
Aplicaciones NGS
Genómica funcional
Epigenómica
Transcriptómica
Microarrays y aplicaciones NGS
Genómica comparada
Prácticas de bioinformática
1. Ejercicios utilizando la plataforma GENOMESPACE
2. Análisis de expresión génica y microarrays
Planificación
Metodologías / pruebas
Competencias / Resultados
Horas lectivas (presenciales y virtuales)
Horas trabajo autónomo
Horas totales
Prácticas a través de TIC
A3 A11 B1
7
14
21
Presentación oral
B5 B9 C2 C3 C8
1.55
6.2
7.75
Sesión magistral
A3 A11 B1 C8
14
28
42
Prueba objetiva
A3 A11 B1 C8
2
0
2
Atención personalizada
2.38
0
2.38
(*)Los datos que aparecen en la tabla de planificación són de carácter orientativo, considerando la heterogeneidad de los alumnos
Metodologías
Metodologías
Descripción
Prácticas a través de TIC
Las TIC constituyen un excelente soporte y canal para el tratamiento de la información y la aplicación práctica de conocimientos, facilitando así la comunicación y aprendizaje.
Presentación oral
El alumnado puede realizar una presentación oral de 10 minutos sobre un tema y bibliografía consensuados con el profesorado.
Sesión magistral
El profesorado explica el contenido principal de cada tema buscando la máxima interacción con el alumnado.
Prueba objetiva
Proba escrita utilizada para la evaluación del aprendizaje y que puede combinar distintos tipos de preguntas.
Atención personalizada
Metodologías
Presentación oral
Prácticas a través de TIC
Descripción
La atención personalizada se concibe como tiempo de interacción directa del estudiante con el profesorado, bien presencialmente, bien vía correo electrónico.
Evaluación
Metodologías
Competencias / Resultados
Descripción
Calificación
Presentación oral
B5 B9 C2 C3 C8
Exposición oral de 10 minutos sobre un artículo científico consensuado con el profesorado. También se evaluará la calidad de las respuestas a preguntas formuladas tras la exposición. Esta actividad no es obligatoria para superar la materia.
15
Prueba objetiva
A3 A11 B1 C8
El examen (tipo test con posibles preguntas de respuesta corta) evaluará los conocimientos adquiridos durante las actividades anteriormente mencionadas. Se requiere un mínimo de 28 (de 70) puntos en esta prueba para superar la materia.
70
Prácticas a través de TIC
A3 A11 B1
La asistencia a las clases prácticas es obligatoria para el alumnado presencial. La evaluación de todo el alumnado se realizará mediante un examen en el que tendrán que resolver varios ejercicios con un ordenador empleando los programas informáticos utilizados en las clases.
Se requiere un mínimo de 8 (de 15) puntos en dicha prueba para superar la materia.
15
Observaciones evaluación
Aquel alumnado con suma de puntuaciones igual o superior a 50 (de 100) puntos, pero que no alcanzase los mínimos exigidos en los exámenes de prácticas y prueba objetiva tendrá una calificación final de 4,5 (sobre 10). Se guardarán las calificaciones aprobadas entre primera y segunda oportunidad.
Podrá optar a Matrícula de Honor el alumnado evaluado en la primera oportunidad (junio).
La calificación de NO PRESENTADO solo se aplicará al alumnado que no realizase NINGUNA de las actividades evaluables.
En el caso de situaciones excepcionales debidamente justificadas podrán adoptarse medidas adicionales para que el estudiante pueda superar la materia, tales como flexibilidad en la fecha de presentación de trabajos o realización de una prueba global de evaluación de los resultados del aprendizaje.
Fuentes de información
Básica
McLachlan, G. J., Do, K-A., Ambroise, C (2004). Analyzing Microarray Gene Expression Data. Wiley-Interscience. John Wiley & Sons
Campbell, A.M & Heyer, L.J. (2007). Discovering Genomics, Proteomics & Bioinformatics. Pearson Benjamin Cummings
Bowtell, D., Sambrook, J. (2003). DNA Microarrays. Cold Spring Harbor Laboratory Press.
Allison, David B., et al (2006). DNA microarrays and related genomics techniques design, analysis, and interpretation of experiments. Chapman & Hall/CRC
E. Rinaldis, A. Lahm. (2007). DNA microarrays: current applications. Wymondham: Horizon Bioscience
Lesk, Arthur M. (2012). Introduction to Genomics. Oxford University Press
Complementária
Straalen, Nico M. van (2006). An introduction to ecological genomics. Oxford University Press
Zhanjiang, Liu (2007). Aquaculture genome techonologies. Blackwell
Futuyama, Douglas J. (2006). Evolution. Sinauer Associates
Dale Jeremy (2008). From genes to genomes: concepst and applications of DNA technology. John Wiley & Sons
Sensen, Christoph W. (2005). Handbook of genome research genomics, proteomics, metabolism, bioinformatics, ethical & legal issues . Wiley-VCH
RECURSOS EN INTERNET:
Biological database compilation at NAR: http://nar.oupjournals.org/content/vol29/issue1
DOE Joint Genome Institut. Why sequence them? http://www.jgi.doe.gov/sequencing/why/index.html
Asignaturas que se recomienda haber cursado previamente
Técnicas Celulares/610441001
Técnicas Moleculares/610441002
Mecanismos de generación de la variación genética/610441005
Regulación de la expresión génica/610441006
Bioinformática y Modelado de Biomoléculas/610441020
Asignaturas que se recomienda cursar simultáneamente
Proteómica/610441013
Cromosomas: Estructura. Función y Evolución/610441015
Genética Humana/610441016
Toxicología Genética/610441017
Asignaturas que continúan el temario
Trabajo de Máster/610441022
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