Study programme competencies |
Code
|
Study programme competences / results
|
A2 |
CE2 – To define, evaluate and select the architecture and the most suitable software for solving a problem in the field of bioinformatics |
A3 |
CE3 – To analyze, design, develop, implement, verify and document efficient software solutions based on an adequate knowledge of the theories, models and techniques in the field of Bioinformatics |
A4 |
CE4 - Ability to acquire, obtain, formalize and represent human knowledge in a computable form for the resolution of problems through a computer system in any field of application, particularly those related to aspects of computing, perception and action in bioinformatics applications |
A6 |
CE6 - Ability to identify software tools and most relevant bioinformatics data sources, and acquire skill in their use |
B1 |
CB6 - Own and understand knowledge that can provide a base or opportunity to be original in the development and/or application of ideas, often in a context of research |
B2 |
CB7 - Students should know how to apply the acquired knowledge and ability to problem solving in new environments or little known within broad (or multidisciplinary) contexts related to their field of study |
B3 |
CB8 - Students to be able to integrate knowledge and deal with the complexity of making judgements from information that could be incomplete or limited, including reflections on the social and ethical responsibilities linked to the application of their skills and judgments |
B6 |
CG1 -Search for and select the useful information needed to solve complex problems, driving fluently bibliographical sources for the field |
B7 |
CG2 - Maintain and extend well-founded theoretical approaches to enable the introduction and exploitation of new and advanced technologies |
C1 |
CT1 - Express oneself correctly, both orally writing, in the official languages of the autonomous community |
C3 |
CT3 - Use the basic tools of the information technology and communications (ICT) necessary for the exercise of their profession and lifelong learning |
C6 |
CT6 - To assess critically the knowledge, technology and information available to solve the problems they face to. |
Learning aims |
Learning outcomes |
Study programme competences / results |
Coñecer e comprender os paradigmas e aspectos máis relevantes do tratamento de datos en bioinformática |
AJ4
|
BJ1 BJ7
|
CJ6
|
Coñecer os principais métodos de aprendizaxe a partir de datos, saber qué tipos principais existen e saber cómo aplicalos. |
AJ2 AJ3 AJ4 AJ6
|
BJ1 BJ2 BJ3 BJ6
|
CJ1 CJ3 CJ6
|
Coñecer os métodos de redución da dimensionalidade |
AJ3 AJ4
|
BJ1 BJ3 BJ7
|
CJ6
|
Saber como debe avaliarse un modelo baseado en datos |
AJ2 AJ3 AJ6
|
BJ3
|
|
Coñecer as plataformas e as ferramentas dispoñibles no campo da Intelixencia Computacional. |
AJ2 AJ3 AJ6
|
BJ2
|
CJ3 CJ6
|
Contents |
Topic |
Sub-topic |
TEMA 1: Introducción á aprendizaxe |
1.1. Areas de aplicación e tipos de problemas
1.2. Características dos sistemas de aprendizaxe
1.3. Perspectiva xeral das distintas aproximacións e tipos de aprendizaxe |
TEMA 2: Teoría da aprendizaxe computacional |
2.1. O problema da precisión.
2.2. A dimensión Vapnik-Chervonenkis
2.3. A maldición da dimensionalidade |
TEMA 3: Aprendizaxe estatística |
3.1. O discriminante lineal de Fisher
3.2. Outros tipos de discriminantes
|
TEMA 4: Aprendizaxe baseada en árboles e reglas de decisión |
4.1. Obxetivo da IA simbólica
4.2. Xeneralidades dos algoritmos de aprendizaxe en IA simbólica
4.3. Listas de decisión
4.4. Inducción de reglas
4.5. Árboles de decisión
4.6. Medidas de rendimiento: entropía e información mutua |
TEMA 5: Redes de neuronas artificiais |
5.1. Conceptos básicos
5.2. O Perceptrón multicapa
5.3. Outros modelos
|
TEMA 6: Aprendizaxe baseada en kernels |
6.1. Nomenclatura e definicións previas
6.2. SVMs lineais
6.3. SVMs non lineais
6.4. SVM Multiclase |
TEMA 7: Métodos de aprendizaxe non supervisados |
7.1. Análisis cluster
7.2. Análisis cluster xerárquico
7.3. Análisis cluster iterativo
7.4. Mapas autoorganizativos |
TEMA 8: Aprendizaxe semisupervisada. |
8.1 Aprendizaxe por reforzo |
TEMA 9: Métodos de reducción da dimensión |
9.1. Extracción de características
9.2. Selección de características |
TEMA 10: Metodoloxía experimental e análise de resultados |
10.1. Diseño experimental
10.2. Preprocesado de datos
10.3. Métodos para a estimación do error
10.4. Métodos de selección de modelos |
Planning |
Methodologies / tests |
Competencies / Results |
Teaching hours (in-person & virtual) |
Student’s personal work hours |
Total hours |
Guest lecture / keynote speech |
A2 A3 A4 B1 B3 B7 C6 |
14 |
21 |
35 |
Supervised projects |
A2 A3 A4 A6 B1 B2 B3 B6 C3 C6 |
0 |
29 |
29 |
Laboratory practice |
A2 A3 A4 A6 B2 C3 |
27 |
27 |
54 |
Oral presentation |
B3 C1 C6 |
3 |
3 |
6 |
Objective test |
A2 A3 A4 A6 B2 C1 C6 |
2 |
18 |
20 |
|
Personalized attention |
|
6 |
0 |
6 |
|
(*)The information in the planning table is for guidance only and does not take into account the heterogeneity of the students. |
Methodologies |
Methodologies |
Description |
Guest lecture / keynote speech |
Exposición oral dos contidos que conforman o marco teórico da materia, complementada co uso de medios audiovisuais e a introdución dalgunhas preguntas dirixidas aos estudantes, co obxectivo de transmitir coñecemento así como de estimular o razoamento crítico do estudante. |
Supervised projects |
Realizaranse varios traballos relacionados cos bloques principais da materia: técnicas de aprendizaxe básicas, técnicas avanzadas e técnicas de selección e extracción de características. Consistirán en actividades de carácter práctico a través das cales se expoñen situacións que requiren ao estudante identificar o problema obxecto de estudo, formulalo con precisión, desenvolver os procedementos pertinentes, aplicar as técnicas vistas en clase, interpretar os resultados e sacar as conclusións oportunas do traballo realizado. Inclúe sesións periódicas co profesor para o seguimento. |
Laboratory practice |
Actividade que permitirá aos estudantes familiarizarse coas ferramentas, plataformas e conxuntos de datos máis comúns no ámbito da aprendizaxe computacional na bioinformática. O obxectivo é que apliquen e asimilen efectivamente os contidos teóricos a través da realización de actividades de carácter práctico, tales como exercicios, experimentos, simulacións e investigacións. |
Oral presentation |
Ao finalizar cada práctica e traballo tutelado os estudantes deben preparar unha sinxela presentación cos principais resultados, conclusións e achegas e expor o traballo realizado na aula. |
Objective test |
Proba escrita utilizada como actividade para a avaliación individual da aprendizaxe. |
Personalized attention |
Methodologies
|
Laboratory practice |
Supervised projects |
|
Description |
O traballo tutelado realizarase, en parte, durante as prácticas de laboratorio e, en gran parte, como traballo autónomo. Para o correcto desenvolvemento será necesario un seguimento periódico que permita aos estudantes aclarar erros de concepto o máis pronto posible e así asegurar a calidade do traballo. Este seguimento realizarase do modo seguinte:
- Cada equipo de prácticas disporá dun tempo exclusivo de titoría dentro das clases prácticas.
- Se establecerá un calendario de controles periódicos non puntuables antes da entrega das prácticas nos que o alumnado terá que enviar o traballo realizado a través de Moodle e, como resposta, recibirá información cos erros máis salientables do mesmo.
Por último, no que se refire as titorías individuais estas serán atendidas, preferentemente nos horarios oficiais das titorías, a través das seguintes canles:
- Correo-e: De uso para facer consultas de resposta curta.
- Teams: encontros virtuais previa solicitude vía correo-e.
|
|
Assessment |
Methodologies
|
Competencies / Results |
Description
|
Qualification
|
Laboratory practice |
A2 A3 A4 A6 B2 C3 |
Prácticas en grupo de realización OBRIGATORIA que abordarán cada un dos temas da materia.
Son OBRIGATORIAS para poder aprobar e inflúen na cualificación final do traballo tutelado, pero non se puntúan á marxe deste. |
0 |
Supervised projects |
A2 A3 A4 A6 B1 B2 B3 B6 C3 C6 |
Traballo en grupo de realización OBRIGATORIA que abordará cada un dos temas da materia. Realizarase en diversas fases ao longo do curso e supón unha avaliación completa e continua sobre todos os aspectos teóricos e prácticos da materia. Inclúe tamén un seguimento de participación activa por parte do estudante.
As condicións e contido concreto detallaranse durante o curso.
Dada a relación direita co contido das prácticas a nota deste apartado inclúe a avaliación das mesmas.
Non se poderá aprobar a materia se se obtén unha puntuación inferior a 5 neste apartado. |
95 |
Oral presentation |
B3 C1 C6 |
Periodicamente establécense sesións de presentación e discusión dos detalles dos traballos tutelados (e as prácticas), os resultados obtidos e as conclusións extraídas.
É OBRIGATORIA para poder aprobar e inflúe na cualificación final do traballo tutelado, pero non se puntúa á marxe deste.
|
0 |
Objective test |
A2 A3 A4 A6 B2 C1 C6 |
Proba escrita utilizada para a avaliación da aprendizaxe de todos ou algúns dos temas da materia.
Poderán realizarse varias probas o longo do curso co fin de facer unha avaliación continua. |
5 |
|
Assessment comments |
OUTRAS NORMAS DE EVALUACIÓN DA ASIGNATURA
A asistencia regular ás clases prácticas, a entrega das mesmas e a súa presentación nas datas e horarios indicados, son condicións obrigatorias para aprobar a materia.
Sobre a responsabilidade compartida dos traballos en grupo
Nas actividades que se levan a cabo en grupos, tales como as prácticas, todos os membros do grupo serán responsables solidarios do traballo realizado e entregado, así como das consecuencias que se deriven do incumprimento das normas de autoría do mesmo.
* Normativa de avaliación, revisión e reclamación das cualificacións dos estudos de grao e máster universitario, aprobada polo Consello de Goberno da Universidade da Coruña o 19 de decembro de 2013.
Non presentado
Un alumno considerarase presentado nunha convocatoria se fai
entrega dalgunha das actividades de avaliación. Avaliación na segunda oportunidade Dado que a superación da materia se centra na superación
dos traballos tutelados, para a segunda oportunidade só será posible reentregar
e presentar os traballos que recibisen a cualificación de SUSPENSO ou NON
PRESENTADO na primeira oportunidade, sempre de acordo ao enunciado que se
propoña a tal fin. En canto aos criterios de
avaliación, a segunda oportunidade estará sometida aos mesmos que a primeira. Matrícula a tempo parcial En caso de matrícula a tempo parcial elimínase a obrigatoriedade da asistencia ás clases de prácticas, pero non a entrega de traballos nin a asistencia ás presentacións orais dos mesmos nas condicións e prazos específicos que se establecerán. Será obriga do estudante comunicar a súa situación ao profesorado.
|
Sources of information |
Basic
|
2nd Edition byBerthold R. (Editor), Hand D.J. (Editor) (1999). Intelligent Data Analysis . Springer. https://www.researchgate.net/publication/235945820_Intelligent_Data_Analysis_An_Introducti
Alpaydin, E. (2004). Introduction to Machine Learning. The MIT Press
Nilsson, N. J. (1996). Introduction to Machine Learning. Draft of Incomplete Notes. http://robotics.stanford.edu/people/nilsson/mlbook.html
Mitchell, T. (1997). Machine Learning. WCB/McGraw-Hill
Michie, D., Spiegelhalter, D. J., Taylor, C. C., (editores) (1994). Machine Learning: Neural and statistical classification. Ellis Horwood. https://www.researchgate.net/publication/2335004_Machine_Learning_Neural_and_Statisti
Bishop, C. (1996). Neural Networks for Pattern Recognition. Oxford University Press |
|
Complementary
|
|
|
Recommendations |
Subjects that it is recommended to have taken before |
Introduction to programming/614522001 | Foundations of Artificial Intelligence/614522003 |
|
Subjects that are recommended to be taken simultaneously |
Advanced statistical methods in bioinformatics/614522009 | Probability. statistics and elements of biomathematics/614522007 |
|
Subjects that continue the syllabus |
Computational intelligence for high dimensional data/614522024 |
|
|