Mestrado Universitario en Bioloxía Molecular , Celular e Xenética
Descriptores
Ciclo
Periodo
Curso
Tipo
Créditos
Máster Oficial
2º cuatrimestre
Primero
Optativa
3
Idioma
Castellano
Inglés
Modalidad docente
Presencial
Prerrequisitos
Departamento
Bioloxía
Coordinador/a
Becerra Fernandez, Manuel
Correo electrónico
manuel.becerra@udc.es
Profesorado
Becerra Fernandez, Manuel
Cerdan Villanueva, Maria Esperanza
Lamas Maceiras, Mónica
Vizoso Vázquez, Ángel José
Correo electrónico
manuel.becerra@udc.es
esper.cerdan@udc.es
monica.lamas@udc.es
a.vizoso@udc.es
Web
Descripción general
Dentro do Máster en Bioloxía Molecular, Celular e Xenética, esta asignatura, ten como obxectivos coñecer e manexar os fundamentos teóricos e as aproximacións experimentais ao análise das propiedades físcias e químicsa das macromoléculas biolóxicas, en especial as proteínas, co fin de relacionar as suas estruturas coa su función e actividade biolóxica. Estudiaranse os conceptos necesarios para a descrición das estruturas, os métodos computacionais e experimentais utilizados para o seu estudio e os fundamentos teóricos que os xustifican.
Competencias del título
Código
Competencias del título
A3
Capacidad de utilizar herramientas Bioinformáticas a nivel de usuario.
A9
Capacidad de comprender la estructura, y función de las proteínas a nivel individual y de la proteómica, así como de las técnicas necesarias para analizarlas y estudiar sus interacciones con otras biomoléculas
B2
Capacidad de toma de decisiones para la resolución de problemas: que sean capaces de aplicar los conocimientos teóricos y prácticos adquiridos en la formulación de problemas biológicos y la búsqueda de soluciones.
B3
Capacidad de gestión de la información: que sean capaces de reunir e interpretar datos, información y resultados relevantes, obtener conclusiones y emitir informes razonados sobre cuestiones científicas y biotecnológicas.
B4
Capacidad de organización y planificación del trabajo: que sean capaces de gestionar la utilización del tiempo así como los recursos disponibles y organizar el trabajo en el laboratorio.
C3
Utilizar las herramientas básicas de las tecnologías de la información y las comunicaciones (TIC) necesarias para el ejercicio de su profesión y para el aprendizaje a lo largo de su vida.
C8
Valorar la importancia que tiene la investigación, la innovación y el desarrollo tecnológico en el avance socioeconómico y cultural de la sociedad.
Resultados de aprendizaje
Resultados de aprendizaje
Competencias del título
Capacidad para comprender los conceptos y teorías relacionados con la dinámica de las
proteínas en las células
AI3 AI9
BI2
CM3 CM8
Familiarización con las fuentes bibliográficas e informáticas donde se puede obtener
información actualizada
AI3 AI9
BI2
CM3 CM8
Conocer los sistemas para la determinación de estructuras mediante difracción de rayos X
AI9
BI2
CM3 CM8
Conocer diferentes programas informáticos para la representación de proteínas y su uso
AI3 AI9
BI2
CM3 CM8
Conocer las técnicas para determinar interacciones entre proteínas y de las proteínas con otras biomoléculas y ligandos.
AI3 AI9
BI4
CM8
Capacidade de interpretar de modo crítico los datos de una publicación de una estructura de una proteína
AI3 AI9
BI3
CM3
Contenidos
Tema
Subtema
Clasificación estructural de las proteínas.
Dominios estructurales de las proteínas. Clasificación de las proteínas de acuerdo a su estructura tridimensional. Proteínas alfa. Proteínas alfa/beta. Proteínas beta. Clases estructurales de proteínas. Clasificación CATH. Clasificación SCOP. Clasificación DALI.Clasificación SMART.
Criterios para la elección de un método de purificación y caracterización
preliminar.
Técnicas cromatográficas: de filtración en gel, intercambio iónico, afinidad, interacción hidrofóbica. Estrategias de purificación. Caracterización preliminar de la conformación proteica: Estado de agregación, de compacidad. Estructura secundaria e indicadores de estructura terciaria. Cuantificación de las proteínas.
Determinación experimental de la estructura de
proteínas mediante difracción de rayos X.
Técnicas de cristalización. Herramientas y estrategias para la toma de datos de
difracción. Interpretación de los difractogramas. Obtención y refinamiento del modelo
molecular. Parámetros para calcular la convergencia del modelo. Modelización.
Interacciones entre biomoléculas.
Las interacciones de las proteínas para la formación de complejos con proteínas y otros ligandos.
Métodos experimentales para determinar estas interacciones y su estructura. El método del doble híbrido. Método de split-ubiquitina. Pull-down. GST-Pull-down. FRET. Ensayos EMSA. Ensayos CHIP. Otras metodologías
Planificación
Metodologías / pruebas
Competéncias
Horas presenciales
Horas no presenciales / trabajo autónomo
Horas totales
Sesión magistral
A9
14
28
42
Prácticas de laboratorio
A9 B3 B2 B4 C8
4
6
10
Prácticas a través de TIC
A3 C3
2
3
5
Prueba mixta
A9
1
15.5
16.5
Atención personalizada
1.5
0
1.5
(*)Los datos que aparecen en la tabla de planificación són de carácter orientativo, considerando la heterogeneidad de los alumnos
Metodologías
Metodologías
Descripción
Sesión magistral
Exposición oral complementada con el uso de medios audiovisuales con la finalidad de transmitir conocimientos y facilitar el aprendizaje.
Prácticas de laboratorio
Metodología que permite al alumnado aprender de forma efectiva, a través de actividades de carácter práctico (demostraciones, simulaciones, etc.) la teoría de un ámbito de conocimiento, mediante la utilización de las tecnologías de la información y las comunicaciones.
Prácticas a través de TIC
Las TIC permiten visualizar modelos de estructura de proteínas y diseñar experimentos de interacción.
Prueba mixta
Combinacion de preguntas de opción multiple y preguntas cortas de relación
Atención personalizada
Metodologías
Prácticas de laboratorio
Prácticas a través de TIC
Descripción
La atención personalizada que se describe en relación a estas metodologías se conciben como momentos de trabajo presencial del alumno con el profesor por lo que implican una participación obligatoria para el alumno.
La forma y el momento en que se desarrollará se indicará en relación a cada actividad a lo largo del curso según el plan de trabajo de la asignatura
Para el alumnado con reconocimiento de dedicación a tiempo parcial y dispensa académica de exención de asistencia, el profesor adoptará las medidas que considere oportunas para no perjudicar su calificación.
Evaluación
Metodologías
Competéncias
Descripción
Calificación
Prácticas de laboratorio
A9 B3 B2 B4 C8
Se evaluará la asistencia regular y la participación activa en las prácticas de laboratorio. Los alumnos en modalidad semipresencial podrán sustituir las prácticas de laboratorio por unos informes de prácticas que se detallarán en el curso.
15
Prueba mixta
A9
Prueba relativa a conocimientos teóricos y prácticos. Los alumnos en modalidad semipresencial además de superar la prueba mixta deberán entregar una serie de tareas que se le irán solicitando a lo largo del curso.
75
Prácticas a través de TIC
A3 C3
Se valorará la asistencia y participación activa. Los alumnos en modalidad semipresencial podrán realizar las prácticas a través de TIC por su cuenta y entregar una memoria/informe del trabajo realizado.
10
Observaciones evaluación
Podrán optar preferentemente a MH los alumnos examinados en la primera oportunidad (Junio).
Para el alumnado con reconocimiento de dedicación a tiempo parcial y dispensa académica de exención de asistencia, el profesor adoptará las medidas que considere oportunas para no perjudicar su calificación.
Fuentes de información
Básica
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spectrometry: recent progress and outlooks • REVIEW . Trends in Biotechnology,
21: 301-305.
§ PhilippeI. H.
Bastiaens and Rainer Pepperkok (2000). Observing proteins in
their natural habitat: the living cell
• REVIEW . Trends in Biochemical Sciences, 25: 631-637
Asignaturas que se recomienda haber cursado previamente
Técnicas Moleculares/610441002
Biología Celular Avanzada/610441003
Asignaturas que se recomienda cursar simultáneamente
Proteínas Recombinantes e Ingeniería de Proteínas/610441012
Proteómica/610441013
Bioinformática y Modelado de Biomoléculas/610441020
Asignaturas que continúan el temario
Trabajo de Máster/610441022
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