Datos Identificativos 2023/24
Asignatura (*) Cristalografía Avanzada Código 610G04042
Titulación
Grao en Nanociencia e Nanotecnoloxía
Descriptores Ciclo Periodo Curso Tipo Créditos
Grado 2º cuatrimestre
Cuarto Optativa 4.5
Idioma
Castellano
Gallego
Inglés
Modalidad docente Presencial
Prerrequisitos
Departamento Bioloxía
Física e Ciencias da Terra
Química
Coordinador/a
López Vicente, Manuel
Correo electrónico
manuel.lopez.vicente@udc.es
Profesorado
Álvarez López, Vanessa
Avecilla Porto, Fernando Francisco
Becerra Fernandez, Manuel
López Vicente, Manuel
Sanchez Andujar, Manuel
Vizoso Vázquez, Ángel José
Correo electrónico
vanessa.alvarez.lopez@udc.es
fernando.avecilla@udc.es
manuel.becerra@udc.es
manuel.lopez.vicente@udc.es
m.andujar@udc.es
a.vizoso@udc.es
Web
Descripción general “Cristalografía Avanzada” é unha materia de carácter aplicado do segundo cuadrimestre do cuarto curso do Grao en Nanociencia e Nanotecnoloxía, que pertence ao Módulo de Formación Optativa. Esta materia profunda sobre os contidos da de primeiro curso “Cristalografía e Simetría” –de carácter Formación Básica–. Trátase dunha materia onde se pretende que o alumnado aprenda a identificar e recoñecer os grupos de simetría espaciais, relacionar as propiedades físicas coa simetría dos cristais, determinar e explicar as estruturas cristalinas mediante difracción de raios X sobre monocristal, e por último, a relación da cristalografía con outras disciplinas. Esta aprendizaxe proporcionará coñecementos expertos e destrezas prácticas que son necesarios para a caracterización dos nanomateriais cristalinos e as macromoléculas biolóxicas.

Competencias del título
Código Competencias del título
A3 CE3 - Reconocer y analizar problemas físicos, químicos, matemáticos, biológicos en el ámbito de la Nanociencia y Nanotecnología, así como plantear respuestas o trabajos adecuados para su resolución, incluyendo el uso de fuentes bibliográficas.
A5 CE5 - Conocer los rasgos estructurales de los nanomateriales, incluyendo las principales técnicas para su identificación y caracterización
A6 CE6 - Manipular instrumentación y material propios de laboratorios para ensayos físicos, químicos y biológicos en el estudio y análisis de fenómenos en la nanoescala.
A7 CE7 - Interpretar los datos obtenidos mediante medidas experimentales y simulaciones, incluyendo el uso de herramientas informáticas, identificar su significado y relacionarlos con las teorías químicas, físicas o biológicas apropiadas.
A8 CE8 - Aplicar las normas generales de seguridad y funcionamiento de un laboratorio y las normativas específicas para la manipulación de la instrumentación y de los productos y nanomateriales.
B3 CB3 - Que los estudiantes tengan la capacidad de reunir e interpretar datos relevantes (normalmente dentro de su área de estudio) para emitir juicios que incluyan una reflexión sobre temas relevantes de índole social, científica o ética
B4 CB4 - Que los estudiantes puedan transmitir información, ideas, problemas y soluciones a un público tanto especializado como no especializado
B6 CG1 - Aprender a aprender
B7 CG2 - Resolver problemas de forma efectiva.
B8 CG3 - Aplicar un pensamiento crítico, lógico y creativo.
B9 CG4 - Trabajar de forma autónoma con iniciativa.
B10 CG5 - Trabajar de forma colaborativa.
C3 CT3 - Utilizar las herramientas básicas de las tecnologías de la información y las comunicaciones (TIC) necesarias para el ejercicio de su profesión y para el aprendizaje a lo largo de su vida
C7 CT7 - Desarrollar la capacidad de trabajar en equipos interdisciplinares o transdisciplinares, para ofrecer propuestas que contribuyan a un desarrollo sostenible ambiental, económico, político y social.
C8 CT8 - Valorar la importancia que tiene la investigación, la innovación y el desarrollo tecnológico en el avance socioeconómico y cultural de la sociedad
C9 CT9 - Tener la capacidad de gestionar tiempos y recursos: desarrollar planes, priorizar actividades, identificar las críticas, establecer plazos y cumplirlos

Resultados de aprendizaje
Resultados de aprendizaje Competencias del título
Identificar y reconocer la simetría y los grupos de simetría espaciales. A3
A5
A7
B3
B6
B7
B8
B9
C3
C8
Calcular la estructura molecular mediante la difracción de rayos-X sobre cristales. A3
A5
A6
A7
A8
B3
B4
B6
B7
B8
C3
C7
C8
Reconocer las propiedades físicas y ópticas de los cristales. A3
A5
A7
B3
B4
B6
B7
B8
C3
C8
Resolver problemas avanzados de cristalografía. A3
A6
A7
A8
B4
B7
B8
B10
C3
C7
C8
C9

Contenidos
Tema Subtema
Tema 1. Simetría espacial, y grupos de simetría espaciales. Conocer los 230 grupos de simetría espacial. Grupos simórficos y no-simórficos: operaciones de traslación. Cristales quirales y enantiómeros (asociados a estructuras de proteínas y moléculas de ácidos nucleicos). Nomenclatura, Diagramas, y Tablas internacionales. Visualizador de grupos espaciales con software libre.
Tema 2. Propiedades físicas y ópticas de los cristales. Relación entre simetría y propiedades magnéticas, dieléctricas y actividad óptica.
Tema 3. Estudio de cristales por difracción de rayos-X. Determinación estructural de macromoléculas biológicas, compuestos orgánicos e inorgánicos mediante cristalografía de Rayos X: Técnicas básicas de cristalización de proteínas y compuestos orgánicos e inorgánicos; Métodos principales para resolver el problema de la fase: reemplazamiento isomorfo múltiple, difracción anómala múltiple y reemplazamiento molecular; Refinamiento y validación de los modelos.

Planificación
Metodologías / pruebas Competéncias Horas presenciales Horas no presenciales / trabajo autónomo Horas totales
Sesión magistral A3 A5 A6 B3 B6 B8 C3 C7 C8 C9 16.5 39.6 56.1
Prácticas de laboratorio A3 A6 A8 B4 B7 B9 B10 C3 C9 10 20 30
Taller A7 B4 B6 B8 B9 B10 C3 7 15.4 22.4
Prueba mixta A3 A6 B3 B7 2 0 2
Actividades iniciales B3 C7 1 0 1
 
Atención personalizada 1 0 1
 
(*)Los datos que aparecen en la tabla de planificación són de carácter orientativo, considerando la heterogeneidad de los alumnos

Metodologías
Metodologías Descripción
Sesión magistral Clases magistrales presenciales de 50 minutos de duración destinadas a impartir los contenidos teóricos de la asignatura con la ayuda de material audiovisual y recursos online.
Prácticas de laboratorio Clases prácticas en las que se identificarán los 230 grupos de simetría espacial con software específico, se observará con casos prácticos la relación entre la simetría y las propiedades magnéticas, dieléctricas y de actividades ópticas; se emplearán técnicas de cristalización para cristalizar una macromolécula biológica y se realizará una simulación de determinación de la estructura de una proteína mediante cristalografía de Rayos X. También se cristalizarán compuestos orgánicos e inorgánicos y se determinará su estructura.
Taller Estas sesiones estarán dedicadas a la resolución de problemas y cuestiones por parte del alumnado, con la orientación del profesorado. Estos problemas se facilitarán secuenciados en el tiempo de acuerdo con los contenidos tratados en las sesiones magistrales. El trabajo se realizará individualmente o en grupos bajo la dirección del profesorado.
Prueba mixta Esta actividad tendrá como objetivo evaluar los conocimientos adquiridos por el alumno mediante una prueba escrita.
Actividades iniciales Sesión introductoria a desarrollar el primer día de clase, en la que se explicará el programa de la asignatura, la metodología, los criterios de evaluación, así como un calendario de cada una de las actividades previstas.

Atención personalizada
Metodologías
Taller
Sesión magistral
Prácticas de laboratorio
Actividades iniciales
Descripción
La atención personalizada se realizará mediante tutorías y entrevistas personales en fechas señaladas. Además, esta atención personalizada podrá llevarse a cabo también de forma telemática, a través del correo electrónico, del campus virtual, y de la plataforma Microsoft Teams. Se prestará especial atención a aquellos alumnos que por sus características especiales puedan tener mayores problemas de aprendizaje y a aquellos con dedicación a tiempo parcial.

Evaluación
Metodologías Competéncias Descripción Calificación
Taller A7 B4 B6 B8 B9 B10 C3 Se calificarán tanto las respuestas del alumnado como su participación individual o en grupo en las actividades presenciales correspondientes. Ocasionalmente, y a solicitud del profesor, el alumnado debe presentar boletines de problemas que también pueden ser evaluados. 15
Prácticas de laboratorio A3 A6 A8 B4 B7 B9 B10 C3 C9 Se evaluarán los siguientes aspectos del trabajo en el laboratorio:
- Organización del trabajo y seguridad.
- Actitud, curiosidad científica y grado de implicación en el trabajo.
- Calidad en la interpretación de los resultados.
- Calidad del informe final (cuaderno de laboratorio).
30
Prueba mixta A3 A6 B3 B7 Consistirá en una prueba sobre contenidos teóricos. Constará tanto de preguntas de desarrollo como de preguntas tipo test y problemas que serán similares a los presentados a lo largo del curso. La calificación mínima requerida para superar esta prueba es de 5 puntos sobre 10. 55
 
Observaciones evaluación

La asignatura estará dividida en tres partes: una centrada
en el estudio de la simetría espacial y los grupos de simetría espaciales, otra
abordará las propiedades físicas y ópticas de los cristales, y la tercera
acerca del estudio de cristales por difracción de rayos-X. Cada una de estas partes
tendrá asignada en la calificación final un tercio del porcentaje de cada
actividad mencionada.



Para superar la materia es requisito imprescindible obtener
una calificación mínima de 5 puntos sobre un máximo de 10 en el cómputo total.
En caso de la ‘Prueba mixta’, la calificación mínima será de 5 sobre 10, y en
los casos de ‘Prácticas de laboratorio’ y ‘Taller’, será de 4,6 sobre 10. Estos
baremos se mantienen para cada una de las tres partes en las que se divide la
asignatura. En caso contrario, la asignatura no será superada. En caso de que
la calificación media entre todas las actividades sea mayor que 5, pero no se
haya superado alguna de las actividades evaluables con las notas previamente
indicadas, la nota que aparecerá en el acta será de 4. Una vez superadas todas
las actividades, la nota final se calculará de la siguiente forma: la ‘Prueba
mixta’ supondrá un 55% de la nota final, las ‘Prácticas de laboratorio’
supondrán el 30% de la calificación final, y la resolución de problemas de ‘Taller’
contribuirá con el 15% restante. La asistencia a clases de taller y prácticas
de laboratorio, y la entrega de problemas son obligatorias para ser evaluados.
La ausencia no justificada a una de las sesiones de laboratorio, o a una
actividad de grupo reducido supondrá la descalificación de la asignatura. El
alumno será declarado NO PRESENTADO solamente si no asiste a ninguna de las
actividades cuya evaluación supone más del 10% de la calificación final.



Las Matrículas de Honor serán otorgadas solamente a los
estudiantes que hayan sido evaluados durante el curso y hayan superado la
correspondiente evaluación en cualquiera de las dos oportunidades, hasta
alcanzar el máximo de Matrículas de Honor posible según la normativa de la
institución.



En las convocatorias de junio (primera oportunidad) y julio
(segunda oportunidad) se evaluará del mismo modo (porcentajes). Los alumnos con
reconocimiento de dedicación a tiempo parcial no tendrán la obligación de
asistir a las clases teóricas ni a las actividades en grupos reducidos, aunque
su asistencia a prácticas sí será obligatoria. El porcentaje de la calificación
correspondiente a las actividades de grupo reducido será asimilado a la
calificación de la prueba mixta tanto en la primera como en la segunda
oportunidad.



Durante la realización de la prueba, en cualquiera de ambas oportunidades, excepto que se indique lo contrario, está prohibido el uso de cualquier dispositivo con acceso a Internet. Si durante la realización de la prueba práctica, hubiera indicio del uso no autorizado de esos dispositivos, él/a estudiante será expulsado del aula, y se procederá según la Ley 3/2022, de 24 de febrero, de convivencia universitaria y el reglamento disciplinar del estudiantado de la UDC. La realización fraudulenta de las pruebas o actividades de
evaluación, una vez comprobada, implicará directamente la calificación de
suspenso en la convocatoria en que se cometa: el/la estudiante será calificado
con “suspenso” (nota numérica 0) en la convocatoria correspondiente del curso
académico, tanto si la comisión de la falta se produce en la primera
oportunidad como en la segunda. Para esto, se procederá a modificar su
calificación en el acta de primera oportunidad, si fuese necesario.



En la convocatoria extraordinaria de diciembre, se aplicarán
los criterios de evaluación de la guía docente del curso 2022-23.


Fuentes de información
Básica

- Sands, Donald E. (1974). Introducción a la cristalografía. Barcelona, Reverté.

- Kettle, Sidney F.A. (2007). Symmetry and structure readable group theory for chemists. Hoboken: John Wiley.

- Borchardt-Ott, Walter (2011). Crystallography : an introduction . Berlin, Springer.

- Dept. de Cristalografía y Biol. Estruc. , CSIC (2020). Crystalografía.

- Hargittai, István (1995). Symmetry through the eyes of a chemist. New York : Plenum Press.

- Hammond, C (2009). The Basics of crystallography and diffraction. Oxford University Press.

- Klein, C; Hurlbut, C.S. Jr. (1996-1997). Manual de mineralogía basado en la obra de J.D. Dana. Vol. 1.. Barcelona, Reverté.

- Bloss, F.D. (1994). Crystallography and crystal chemistry: an introduction. Washington, Mineralogical Society of America.

- Tilley, Richard J.D.  (2020). Crystals and Crystal Structures, 2nd Edition. Editorial Willey. ISBN: 978-1-119-54859-1.

- Bergfors. T.M. (2022). Protein Crystallization, 3th Edition. International University Line.

- Rodes, G. (2010). Crystallography Made Crystal Clear: A Guide for Users of Macromolecular Models. 3th Edition. Academic Press.

Complementária

- Müller, Ulrich (2013). Relaciones de simetría entre estructuras cristalinas : aplicaciones de la teoría de grupos cristalográficos en cristaloquímica. Madrid

- DAVID J. WILLOCK (2009). Molecular Symmetry. Willey

- Giacovazzo, C (2011). Fundamentals of crystallography. Oxford ; New York : Oxford University Press

- Amorós, J.L. (1990). El Cristal : morfología, estructura y propiedades físicas. Madrid, Ed. Atlas

- Nesse, W.D. (2009). Introduction to optical mineralogy. New York : Oxford University Press

- Amigo, J.M. et al. (1981). Cristalografía. Madrid, Rueda.


Recomendaciones
Asignaturas que se recomienda haber cursado previamente
Cristalografía y Simetría/610G04006

Asignaturas que se recomienda cursar simultáneamente

Asignaturas que continúan el temario

Otros comentarios

Programa de la Facultad de Ciencias 'Green Campus'

Para contribuir a lograr un entorno sostenible inmediato y cumplir con el punto 6 de la “Declaración Ambiental de la Facultad de Ciencias (2020)”, los trabajos documentales realizados en esta materia:

a) Se solicitarán mayoritariamente en formato virtual y soporte informático.

b) De realizarse en papel:

- No se utilizarán plásticos.

- Se realizarán impresiones a doble cara.

- Se utilizará papel reciclado.

- Se evitarán borradores.

Incorporación de la perspectiva de género

- Según se recoge en las distintas normativas de aplicación para la docencia universitaria se deberá incorporar la perspectiva de género en esta materia (se usará lenguaje no sexista, se utilizará bibliografía de autores/as de ambos sexos, se propiciará la intervención en clase de alumnos y alumnas...).

- Se trabajará para identificar y modificar prejuicios y actitudes sexistas y se influirá en el entorno para modificarlos y fomentar valores de respeto e igualdad.

- Se deberán detectar situaciones de discriminación por razón de género y se propondrán acciones y medidas para corregirlas.



(*) La Guía Docente es el documento donde se visualiza la propuesta académica de la UDC. Este documento es público y no se puede modificar, salvo cosas excepcionales bajo la revisión del órgano competente de acuerdo a la normativa vigente que establece el proceso de elaboración de guías