Avaliación na primeira oportunidade

Poderá ser tido en
conta o seguimento obxetivable do
curso e a
participación activa pola parte do estudiante, reflectíndose na
calificación con ata un 20% da nota final. A porcentaxe restante
da calificación (entre 80% e 100%) dependerá da evaluación
da Proba mixta e, se procede, do Traballo tutelado optativo, e
calcularase reescalando se é preciso as porcentaxes que figuran na
táboa superior.

Para superar a materia é necesario acadar unha calificación total mínima de 50 puntos, sendo en

todo caso obligatoria a presentación á Proba mixta. Quen non se
presente á Proba mixta será calificado como 'non presentado'.

Avaliación na segunda oportunidade

Farase con criterios similares aos da primeira oportunidade. O alumnado que houbera presentado un Traballo tutelado optativo na primeira
oportunidade poderá optar entre conservar a nota obtida na súa avaliación na primeira oportunidade ou presentar un novo traballo.

O alumnado con recoñecemento de dedicación a tiempo
parcial e dispensa académica de exención de asistencia que decida non asistir regularmente ás clases, será
evaluado nas dúas oportunidades como o resto do alumnado que se atopa nunha situación similar.

Learning outcomes	Study programme competences
Coñecer os principios estatísticos da análise de sistemas de altas prestacións para o estudo da expresión xénica	AJ5 AJ6	BJ1 BJ2 BJ6 BJ7	CJ3 CJ6
Comprender os aspectos estatísticos da construción de árbores filoxenéticas	AJ5 AJ6	BJ1 BJ2 BJ6 BJ7	CJ3 CJ6
Coñecer os fundamentos dos principais modelos estocásticos empregados en xenética de poblacións	AJ5 AJ6	BJ1 BJ2 BJ6 BJ7	CJ3 CJ6
Entender as bases probabilísticas e estatísticas dos métodos de análise de secuencias biolóxicas	AJ5 AJ6	BJ1 BJ2 BJ6 BJ7	CJ3 CJ6

Topic	Sub-topic
1. Análise estatística de sistemas de altas prestacións para o estudo da expresión xénica	Preprocesamento dos datos de microarrays. Multiplicidade dos contrastes de hipóteses nos estudos de expresión xénica diferencial. Análise de conglomerados de mostras e xenes.
2. Árbores filoxenéticas	Modelos de evolución das secuencias de ADN. Construción e estimación de árbores filoxenéticas: métodos baseados nos conceptos de parsimonia, distancia e máxima verosimilitude. Contrastes sobre filoxenias e métodos relacionados.
3. Introducción ós modelos estocásticos en xenética de poblacións	O modelo de Wright-Fisher. O coalescente: o coalescente básico, contrastes da hipótese de neutralidade, extensións do coalescente.
4. Aspectos estatísticos da análise de secuencias biolóxicas	Sistemas de puntuación de alineamentos. Análise da significación estatística de alineamentos de secuencias.

Methodologies / tests	Competencies	Ordinary class hours	Student’s personal work hours	Total hours
Guest lecture / keynote speech	A5 B1 B7	18	40	58
Problem solving	B2 B6 C6	12	28	40
ICT practicals	A5 A6 B2 C3	12	25	37
Mixed objective/subjective test	A5	3	0	3
Supervised projects	B6	0	10	10

Personalized attention		2	0	2

(*)The information in the planning table is for guidance only and does not take into account the heterogeneity of the students.

Methodologies	Description
Guest lecture / keynote speech	Exposición oral complementada co uso de medios audiovisuais, coa finalidade de transmitir ó estudiante os coñecementos teóricos
Problem solving	Seminarios en grupos de tamaño intermedio destinados á resolución de exercicios e problemas
ICT practicals	Resolución de supostos prácticos e teóricos mediante a utilización de software estatístico
Mixed objective/subjective test	Proba con preguntas de tipo test de opcións múltiples e/ou preguntas de resposta breve realizada co fin de evaluar globalmente a adquisición de coñecementos polo estudiante
Supervised projects	Traballos realizados polo estudiante sobre temas relacionados coa materia

Methodologies	Competencies	Description	Qualification
Mixed objective/subjective test	A5	Proba que constará de preguntas de tipo test con opcións múltiples e/ou con preguntas de breve resposta	75
Supervised projects	B6	Traballo optativo realizado polo alumno ou alumna	25

Assessment comments
Avaliación na primeira oportunidade Poderá ser tido en conta o seguimento obxetivable do curso e a participación activa pola parte do estudiante, reflectíndose na calificación con ata un 20% da nota final. A porcentaxe restante da calificación (entre 80% e 100%) dependerá da evaluación da Proba mixta e, se procede, do Traballo tutelado optativo, e calcularase reescalando se é preciso as porcentaxes que figuran na táboa superior. Para superar a materia é necesario acadar unha calificación total mínima de 50 puntos, sendo en todo caso obligatoria a presentación á Proba mixta. Quen non se presente á Proba mixta será calificado como 'non presentado'. Avaliación na segunda oportunidade Farase con criterios similares aos da primeira oportunidade. O alumnado que houbera presentado un Traballo tutelado optativo na primeira oportunidade poderá optar entre conservar a nota obtida na súa avaliación na primeira oportunidade ou presentar un novo traballo. O alumnado con recoñecemento de dedicación a tiempo parcial e dispensa académica de exención de asistencia que decida non asistir regularmente ás clases, será evaluado nas dúas oportunidades como o resto do alumnado que se atopa nunha situación similar.

Basic	Gentleman R, Carey V J, Huber W, Irizarry R A, Dudoit S (eds.) (2005). Bioinformatics and Computational Biology Solutions using R and Bioconductor. Springer Wakeley J (2008). Coalescent Theory. Freeman Felsenstein J (2004). Inferring Phylogenies. Sinauer Bioconductor Project (). Sitio web Bioconductor. https://www.bioconductor.org/ R (2018). Sitio web programa R. http://www.r-project.org/ Ewens W J, Grant G R (2005). Statistical Methods in Bioinformatics. Springer

Complementary

Other comments