| Competencias do título |
| Código | Competencias do título |
| A1 | CE1 - Capacidade para coñecer o eido de aplicación da bioinformática e os seus aspectos más importantes |
| A2 | CE2 - Definir, avaliar e seleccionar a arquitectura e o software máis axeitado para resolver un problema no campo da Bioinformática |
| A3 | CE3 - Analizar , deseñar , desenvolver, implementar , verificar e documentar solucións software eficientes sobre a base dun coñecemento adecuado das teorías, modelos e técnicas actuais no eido da Bioinformática |
| A6 | CE6 – Capacidade para identificar as ferramentas software e fontes de datos de bioinformática máis relevantes, e adquirir destreza no seu uso |
| A8 | CE8 - Comprender a base da información do material hereditario, a súa transmisión, análise e evolución |
| A9 | CE9 - Entender os beneficios e comprender os problemas asociados a secuenciación e ao uso de secuencias biolóxicas, así como coñecer as estruturas e técnicas para o seu procesamento |
| B1 | CB6 – Posuír e comprender o coñecemento que fornecen unha base ou oportunidade de orixinalidade no desenvolvemento e / ou aplicación de ideas, a miúdo nun contexto de investigación. |
| B2 | CB7 - Que os estudantes saiban aplicar os coñecementos adquiridos e a súa capacidade de resolución de problemas en contornas novas ou pouco coñecidas dentro de contextos máis amplos (ou multidisciplinares) relacionados coa súa área de estudo |
| B8 | CG3 - Ser capaz de traballar en equipa, en especial de carácter interdisciplinar |
| C6 | CT6 - Valorar criticamente o coñecemento, a tecnoloxía e a información dispoñibles para resolver os problemas cos que deben enfrontarse |
| C7 | CT7 - Manter e asentar estratexias encamiñadas a actualización científica como criterio de mellora profesional. |
| Resultados de aprendizaxe | |||
| Resultados de aprendizaxe | Competencias do título | ||
| Coñecer as principais estruturas de datos usadas no estado da arte para o almacenamento compacto e auto-indexado de secuencias, e algoritmos para o seu uso. | AP1 AP2 AP9 |
||
| Crear estruturas de datos comprimidas para realizar tarefas de análise e aliñamento de secuencias de forma eficiente en tempo e espazo. | AP2 AP3 AP6 AP8 |
BP1 BP2 BP8 |
CP6 CP7 |
| Coñecer os problemas asociados á predicción da estrutura secundaria e terciaria das proteínas e a súa importancia, así como os principais métodos de predicción do estado da arte. | AP1 AP2 AP3 AP6 AP9 |
BP1 |
CP6 CP7 |
| Contidos |
| Temas | Subtemas |
| Compresión de secuencias biolóxicas | Lempel-Ziv Compresión de gramáticas |
| Indexación de secuencias biolóxicas | Transformada de Burrows-Wheeler FM-index Aplicacións en busca e ensamblaxe |
| Representación sucinta de grafos e redes biolóxicas | Estruturas para a representación compacta de grafos Representación de redes biolóxicas Aplicacións a secuencias biolóxicas |
| Predicción de estrutura de proteínas |
Conceptos básicos de proteínas Predicción de estrutura secundaria con métodos de aprendizaxe máquina Métodos de predicción de estrutura terciaria Modelado do plegado de proteínas |
| Planificación | ||||
| Metodoloxías / probas | Competencias | Horas presenciais | Horas non presenciais / traballo autónomo | Horas totais |
| Sesión maxistral | A1 A2 A3 A6 A8 A9 | 11 | 11 | 22 |
| Proba mixta | A1 A2 A3 A6 A8 A9 B2 | 4 | 0 | 4 |
| Prácticas a través de TIC | A1 A2 B1 B2 B8 C6 C7 | 10 | 38 | 48 |
| Atención personalizada | 1 | 0 | 1 | |
| *Os datos que aparecen na táboa de planificación son de carácter orientativo, considerando a heteroxeneidade do alumnado | ||||
| Metodoloxías |
| Metodoloxías | Descrición |
| Sesión maxistral | Exposición dos contidos da materia |
| Proba mixta | Realización dunha proba final para demostrar os coñecementos e competencias adquiridos durante as sesións maxistrais e as prácticas na aula |
| Prácticas a través de TIC | Realización de prácticas, individuais ou en grupo, para desenvolver os conceptos adquiridos nas clases maxistrais |
| Atención personalizada |
|
|
| Avaliación | |||
| Metodoloxías | Competencias | Descrición | Cualificación |
| Proba mixta | A1 A2 A3 A6 A8 A9 B2 | Constará dunha proba na que deben ser demostrados os coñecementos e competencias adquiridos. Para aprobar a materia globalmente hai que obter unha NOTA MÍNIMA de 1 (sobre 2) nesta proba. Non sendo así, a nota máxima global da materia non será en ningún caso superior a 4,9 e a materia considerarase sustpensa. |
20 |
| Prácticas a través de TIC | A1 A2 B1 B2 B8 C6 C7 | Os estudantes deberán entregar boletíns cos resultados das prácticas realizadas ou solución aos problemas propostos. | 80 |
| Observacións avaliación | |||
|
PRIMEIRA OPORTUNIDADE
Terá calificación de NON PRESENTADO calquera estudante que non realice a proba mixta. SEGUNDA OPORTUNIDADESó poderán presentarse á segunda oportunidade aqueles estudantes que non superen a materia na primeira oportunidade. Na segunda oportunidade terá calificación de NON PRESENTADO calquera estudante que non opte a recuperar ningunha das partes. OPORTUNIDADE ADIANTADA: A avaliación na oportunidade adiantada consistirá dunha proba escrita (100% da nota final), que recollerá os coñecementos e competencias adquiridos durante as sesións maxistrais e as prácticas. DISPENSA ACADÉMICA: Aqueles PRIMEIRA OPORTUNIDADE Oportunidade ganar |
|||
| Fontes de información |
| Bibliografía básica |
N. C. Jones, P. A. Pevzner (2004). An introduction to bioinformatics algorithms. MIT Press
V. Mäkinen, D. Belazzougui, F. Cunial, A.I.Tomescu (2015). Genome-scale algorithm design. Cambridge University Press
A. Tramontano (2006). Protein structure prediction: Concepts and Applications. Wiley-VCH |
|
|
|
| Bibliografía complementaria |
T.K. Attwood, D.J. Parry-Smith (2002). Introducción a la bioinformática. Pearson educacion |
|
|
| Recomendacións | |
| Materias que se recomenda ter cursado previamente | |
|
| Materias que se recomenda cursar simultaneamente |
| Materias que continúan o temario |
| Observacións | |