Teaching GuideTerm Faculty of Computer Science |
Mestrado Universitario en Bioinformática para Ciencias da Saúde |
Subjects |
Advanced statistical methods in bioinformatics |
Contents |
|
|
Identifying Data | 2020/21 | |||||||||||||
Subject | Advanced statistical methods in bioinformatics | Code | 614522009 | |||||||||||
Study programme |
|
|||||||||||||
Descriptors | Cycle | Period | Year | Type | Credits | |||||||||
Official Master's Degree | 2nd four-month period |
First | Obligatory | 6 | ||||||||||
|
Topic | Sub-topic |
1. Análise estatística de sistemas de altas prestacións para o estudo da expresión xénica |
Xeneralidades sobre o estudo da expresión xénica con microarrays e RNA-seq. Preprocesamento dos datos de microarrays e RNA-seq. Análise de conglomerados de mostras e xenes. Multiplicidade dos contrastes de hipóteses nos estudos de expresión xénica diferencial. Métodos estatísticos para a análise da expresión xénica diferencial con RNA-seq. |
2. Árbores filoxenéticas |
Modelos de evolución das secuencias de ADN. Construción e estimación de árbores filoxenéticas: métodos baseados nos conceptos de parsimonia, distancia e máxima verosimilitude. Contrastes sobre filoxenias e métodos relacionados. |
3. Introducción ós modelos estocásticos en xenética de poblacións | O modelo de Wright-Fisher. O coalescente: o coalescente básico, contrastes da hipótese de neutralidade, extensións do coalescente. |
4. Aspectos estatísticos da análise de secuencias biolóxicas | Sistemas de puntuación de alineamentos. Análise da significación estatística de alineamentos de secuencias. |
|